员工在上下班途中发生交通事故，且存在第三方责任的，一般能认定为工伤，但前提是员工在事故中不承担主要责任。以下是对此问题的详细分析：
一、工伤认定的基本条件
根据《工伤保险条例》及相关规定，员工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，可以认定为工伤。这里的“非本人主要责任”是关键，意味着员工在事故中的责任比例不能超过50%。如果员工承担主要责任或全部责任，则不能认定为工伤。
二、第三方责任的影响
第三方全责：如果交通事故中第三方全责，即员工在事故中无责任，那么这完全符合工伤认定的条件。员工可以依法申请工伤认定，并享受相应的工伤保险待遇。
第三方部分责任：如果交通事故中第三方承担部分责任，而员工也承担一定责任（但非主要责任），那么员工仍然有可能被认定为工伤。具体责任比例需要根据公安机关交通管理部门的事故责任认定书来确定。
三、工伤认定的程序与材料
申请时间：用人单位应在事故伤害发生之日起30日内提出工伤认定申请；用人单位未申请的，工伤职工或其近亲属、工会组织可在1年内提出。
申请材料：包括劳动合同、医疗诊断证明、事故责任认定书等。其中，事故责任认定书是证明员工在事故中责任比例的关键材料。
四、特殊情况下的工伤认定
加班后上下班途中：员工加班加点后上下班的途中，如果受到非本人主要责任的交通事故伤害，同样可以认定为工伤。
合理路线与时间：员工在上下班途中必须是在合理的时间和路线上发生的交通事故，才能被认定为工伤。例如，员工绕道去办私事途中发生的交通事故，可能不被认定为工伤。
五、法律建议
及时报警并保留证据：发生交通事故后，员工应及时报警并保留好相关证据，如事故现场照片、医疗诊断证明、事故责任认定书等。
及时申请工伤认定：员工应在规定时间内向用人单位或社会保险行政部门提出工伤认定申请，以免错过申请时效。
咨询专业律师：如果员工在工伤认定过程中遇到问题或争议，可以及时咨询专业律师以获取法律帮助。
举例说明：假设员工小李在上下班途中被一辆闯红灯的汽车撞伤，经公安机关交通管理部门认定，小李在事故中无责任。那么，小李可以依法申请工伤认定，并享受相应的工伤保险待遇。
综上所述，员工在上下班途中发生交通事故且存在第三方责任的，一般能认定为工伤，但前提是员工在事故中不承担主要责任。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。