建筑工程施工合同的逾期付款违约金计算，主要依据合同约定及法律规定来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、合同有约定的情况
按照合同约定执行：
- 如果建筑工程施工合同中明确约定了逾期付款违约金的数额或计算方法，那么原则上应按照合同约定来执行。这是合同自由原则的体现，也是双方意思自治的结果。
违约金的调整：
- 约定的违约金并非不可调整。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果约定的违约金过分高于实际损失（通常指超过损失的30%），人民法院或仲裁机构可根据当事人的请求适当减少；反之，如果约定的违约金低于实际损失，也可相应增加。这一规定旨在平衡双方当事人的利益，防止违约金过高或过低导致的不公平现象。
二、合同没有约定的情况
参照相关司法解释：
- 如果合同中没有约定逾期付款违约金或其计算方法，那么可以参照相关司法解释来确定损失赔偿。具体来说，对于违约行为发生在2019年8月19日之前的，可依据中国人民银行同期同类人民币贷款基准利率为基础，参照逾期罚息利率标准计算；对于违约行为发生在2019年8月20日之后的，则依据违约行为发生时中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心公布的一年期贷款市场报价利率（LPR）标准为基础，加计30%—50%计算逾期付款损失。
损失赔偿的范围：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。这一规定明确了损失赔偿的范围和限度，有助于防止损失赔偿的扩大化。
三、主张违约金的注意事项
及时主张权利：
- 守约方应在诉讼时效期间内（一般为三年）及时向违约方主张违约金，以避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。这是保护自身权益的重要措施。
保留相关证据：
- 为证明对方存在逾期付款的违约行为以及自己所遭受的损失，守约方应妥善保留建筑工程施工合同、工程验收报告、付款凭证、催款通知等相关证据。这些证据在主张违约金时具有至关重要的作用。
四、违约金与合同履行的关系
- 支付违约金并不免除违约方继续履行合同的义务。除非合同中有特别约定或双方另有协议，否则违约方在支付违约金的同时，仍需按合同约定履行付款义务。这一规定确保了合同的继续履行和双方权益的有效保护。
建议：在签订建筑工程施工合同时，双方应仔细审查关于逾期付款和违约金的条款，确保其内容合理、明确，并符合法律法规的规定。这有助于避免未来可能发生的纠纷，保障双方的合法权益。如果您在工程付款违约金计算的过程中，对于违约金调整幅度、无约定时的准确计算等存在疑惑，可以直接向我咨询。