行政诉讼中法院已调解的案件，当事人撤诉后，原则上不能就调解后的行政处罚再次起诉，但存在特定例外情况。以下是对此问题的详细分析：

一、原则规定

根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》的相关规定，人民法院裁定准许原告撤诉后，原告以同一事实和理由重新起诉的，人民法院通常不予立案。这一规定旨在防止当事人滥用诉权，维护司法资源的合理分配，以及保障行政行为的稳定性和司法裁判的权威性。在行政诉讼中，当事人经调解达成协议后申请撤诉，意味着对自身诉讼权利的处分和对当前处理结果的接受。因此，从原则上讲，撤诉后不得再就同一事实和理由重新起诉。

二、特殊例外情况

尽管原则上不允许重新起诉，但在以下特殊情况下，原告可能仍有权以同一事实和理由重新提起诉讼：

1. 调解协议存在不正当行为：

   • 如果调解协议的签署存在被威胁、被欺骗等不正当行为，导致明显的不公，那么原告有权依法起诉。在这种情况下，调解协议并非原告的真实意愿表示，因此不应成为阻碍原告重新起诉的理由。

2. 调解协议违反法律或法规中的强制性规定：

   • 如果调解协议违反了法律或法规中的强制性规定，那么该协议自始无效。原告有权对无效的调解协议提出质疑，并就调解后的行政处罚提起诉讼。

3. 发现新的证据足以推翻原行政行为：

   • 如果原告在撤诉后发现了新的证据，这些证据足以推翻原行政行为，那么原告有权重新提起诉讼。然而，在实践中，要证明存在这些新证据并不容易，原告需要提供充分的证据来支持其主张。

三、实际操作建议

对于行政诉讼中的调解撤诉及后续可能的重新起诉问题，建议当事人注意以下几点：

• 在决定撤诉前充分考量：

  • 在决定撤诉前，当事人应充分考虑撤诉的法律后果，确保自身权益不受损害。如果对调解协议或行政处罚存在疑虑，建议咨询专业律师后再做决定。

• 及时咨询专业律师：

  • 如因非自愿原因撤诉，或撤诉后发现新证据，当事人应及时咨询专业律师，了解重新起诉的可能性和相关程序。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助。

• 收集并整理好相关证据：

  • 在准备重新起诉时，当事人务必收集并整理好所有相关证据，以确保诉讼的成功率。证据是诉讼的关键，充分的证据可以支持当事人的主张并增加胜诉的可能性。

如有相关疑问或需求，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供准确的法律意见和帮助。