公司不能停业六个月以上的主要原因是，根据相关法律法规，公司成立后无正当理由超过六个月未开业，或者开业后自行停业连续六个月以上的，公司登记机关有权吊销其营业执照。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

1. 《公司法》第二百一十一条：公司成立后无正当理由超过六个月未开业的，或者开业后自行停业连续六个月以上的，可以由公司登记机关吊销营业执照。
2. 《公司登记管理条例》第六十八条：同样规定了公司成立后无正当理由超过六个月未开业，或者开业后自行停业连续六个月以上的，公司登记机关可以吊销其营业执照。
3. 《个人独资企业法》第三十六条和第四十四条：也针对个人独资企业有类似的规定，即成立后无正当理由超过六个月未开业，或者开业后自行停业连续六个月以上的，吊销营业执照。

法律后果

• 吊销营业执照：这是对公司或个人独资企业长期停业不经营的最严厉处罚。吊销营业执照意味着公司失去了合法经营的资格，必须停止一切经营活动，并进行清算注销。

实际操作与建议

1. 停业手续：虽然公司停业无需办理停业手续，但停业六个月以上需要办理注销手续。这是为了避免公司长期处于停业状态，占用社会资源，同时保护债权人的利益。
2. 合规经营：公司应依法开展经营活动，避免长期停业。如果确实需要停业，应尽快办理相关手续，并在停业期间妥善处理公司事务，如员工安置、债务清偿等。
3. 法律风险：长期停业不仅可能导致营业执照被吊销，还可能引发其他法律风险，如员工劳动争议、债权人追债等。因此，公司应谨慎对待停业问题，确保合规经营。

特殊情况考虑

• 正当理由：如果公司有正当理由需要停业超过六个月，如进行重大资产重组、等待政策调整等，应及时向公司登记机关说明情况，并按照相关规定办理手续。但这种情况较为特殊，且需要提供充分的证据支持。

综上所述，公司不能停业六个月以上的主要原因是法律法规的明确规定。公司应依法开展经营活动，避免长期停业带来的法律风险。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。