结论前置：上班时长超过12小时，但实际工作时长未超过8小时，一般不算加班。不过，具体是否算加班还需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、从法律规定角度分析

根据我国《劳动法》第三十六条：“国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。”以及加班的定义：“加班，是指除法定或者国家规定的工作时间以外，正常工作日延长工作时间或者双休日以及国家法定假期期间延长工作时间。”

• 若上班12小时中，实际工作未超8小时：这意味着在12小时的上班时间内，有部分时间并非处于实际工作状态，如等待任务、休息等。由于实际工作时长未超过法定8小时，因此这部分超出时间通常不被认定为加班。
• 若存在实际工作超8小时的情况：即便总上班时长未明确超过12小时，但只要实际工作时长超过了8小时，超出部分就应被认定为加班，用人单位需支付相应的加班费。

二、从特殊工时制度角度分析

企业因生产特点无法实行标准工时制时，经劳动行政部门批准，可以采用其他工作和休息办法，如不定时工作制或综合计算工时工作制。

• 不定时工作制：在这种制度下，劳动者的工作时间不受固定时数限制，因此不存在加班的概念。但需注意，不定时工作制需经劳动行政部门批准，且用人单位应确保劳动者的休息权利。
• 综合计算工时工作制：在这种制度下，劳动者的工作时间在一个计算周期内（如周、月、季、年）综合计算，平均日和平均周工作时间不超过法定标准工作时间。若在一个计算周期内，劳动者的实际工作时间超过了法定标准，超出部分应视为加班。

三、法律建议与可能后果

• 对于劳动者：若认为自己的工作时间安排存在问题，或用人单位未依法支付加班费，可收集相关证据（如考勤记录、工资条等），通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径维护自身权益。
• 对于用人单位：应严格遵守劳动法律法规，合理安排劳动者的工作时间，确保劳动者的休息权利。若需采用特殊工时制度，应依法经劳动行政部门批准，并告知劳动者。否则，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动者的维权诉讼。

举例说明：假设某劳动者每日上班12小时，但其中包含2小时的等待任务时间和2小时的休息时间，实际工作时长为8小时。在这种情况下，由于实际工作时长未超过法定8小时，因此超出时间不被认定为加班。但若该劳动者每日实际工作时长为10小时，则超出部分应被认定为加班，用人单位需支付相应的加班费。

总结：上班时长超过12小时，但实际工作时长未超过8小时，一般不算加班。但具体是否算加班还需结合实际情况和特殊工时制度来判断。若遇到相关问题，建议直接向我咨询，以便更准确地维护自身权益。