在劳动仲裁取得胜利并申请强制执行后，若对方支付了款项，整个流程的处理需要遵循一定的法律程序和规范。以下是对此问题的详细解答：

一、执行款项的收取与手续办理

1. 执行款项的收取：

   • 当对方支付执行款项后，这些款项会首先由执行法院收取。法院会设立专门的账户来接收和管理这些执行款项，以确保资金的安全和规范使用。

2. 手续办理：

   • 法院在收到执行款项后，会按照规定办理一系列相关手续。这包括出具正规的收款凭证，以证明款项的收取和来源。这些手续是执行程序的必要环节，旨在保障执行过程的规范性和透明度。

二、申请执行人的配合与了解

1. 积极配合法院工作：

   • 申请执行人（即劳动者）需要积极配合法院的后续工作。这包括提供必要的身份证明和案件相关材料，以及协助法院核实款项是否足额到账。

2. 了解款项支付情况：

   • 申请执行人可以主动向法院了解款项的具体支付情况，包括支付时间、支付金额等。法院会及时通知申请执行人款项已执行到位，并告知后续还需完成的流程。

三、案件的后续处理与结案

1. 结案操作：

   • 法院会根据案件的实际情况进行结案等操作。如果案件执行完毕，即对方已支付全部执行款项，法院会制作执行终结裁定书，并送达给各方当事人。

2. 材料整理与归档：

   • 执行过程中产生的相关材料，如执行记录、证据等，都会被法院整理归档保存。这些材料是后续查询和审查的重要依据，有助于保障执行程序的合法性和有效性。

四、申请执行人的注意事项

1. 密切关注法院通知：

   • 申请执行人需要密切关注法院的通知，确保及时了解案件的执行进展和后续流程。这有助于申请执行人及时行使自己的权利，并保障自身合法权益得到妥善落实。

2. 保留相关证据和文件：

   • 申请执行人应妥善保留与案件相关的所有证据和文件，包括仲裁裁决书、强制执行申请书、收款凭证等。这些证据和文件在后续查询和审查中可能起到关键作用。

五、示例说明

假设劳动者小张在劳动仲裁中取得胜利，并申请了强制执行。在执行过程中，对方公司支付了全部执行款项。此时，法院会收取这些款项，并出具正规的收款凭证。小张需要积极配合法院的后续工作，包括核实款项是否足额到账。一旦确认足额，法院会及时通知小张款项已执行到位，并制作执行终结裁定书送达给各方当事人。同时，法院会整理归档相关材料，以备后续查询和审查。

综上所述，当劳动仲裁强制执行后对方支付了款项，申请执行人需要积极配合法院的工作，了解款项的支付情况，并密切关注法院的通知。同时，保留好相关证据和文件也是非常重要的。