物业存档业主产权证复印件的合法性需根据具体情况判断。以下从合法与不合法两种情况进行分析，并提供相应的法律建议：
合法情况
基于物业服务合同约定：
- 如果业主与物业签订的物业服务合同中明确约定了物业为了提供特定服务（如确认业主身份以便准确提供个性化专属服务、精准投递重要通知或文件、办理小区事务的登记等）需要业主提供房产证复印件，且在合理范围内，那么业主应按照合同约定配合提供。这种行为具有合法性，因为合同是双方自愿达成的协议，对双方均具有约束力。
配合政府相关部门工作：
- 在特定地区，政府相关部门可能要求物业公司配合进行房屋安全普查等涉及公共安全或社会公共利益的事项。此时，物业收集业主的房产证复印件以提供必要信息，是基于履行法定协助义务，属于合法行为。物业在此情况下有责任确保信息的合法收集和使用。
社区管理与服务需求：
- 物业作为提供综合服务的组织，为了更好地开展小区管理工作（如办理门禁卡、进行房屋维修登记等），可能需要确认业主身份和房屋产权信息。这些行为在合法、正当、必要的原则下是合理的，且物业有责任妥善保管这些信息，避免泄露。
不合法情况
超出合理服务范围：
- 如果物业没有合理的理由，仅仅是为了方便自身管理或者将业主信息用于与物业服务无关的目的（如出售给第三方用于商业推销等），这种要求是不合理且不合法的。它侵犯了业主的隐私权和个人信息权益，业主有权拒绝提供并可以向相关部门投诉。
未履行保密义务：
- 即使物业基于合理原因收集了业主的房产证复印件，但如果未采取妥善的保密措施导致信息泄露，给业主造成损失，物业的行为也是存在过错且违法的。物业应承担相应的法律责任，包括赔偿业主的损失等。
法律建议
- 询问与知情权：业主在提供房产证复印件前，有权询问清楚物业的用途和依据。如果认为物业的要求不合理或不合法，业主有权拒绝提供，并可以向相关部门（如房地产管理部门、消费者协会等）投诉以维护自己的合法权益。
- 注明用途与限制：业主在提供房产证复印件时，可以注明具体用途，并要求物业妥善保管，不得用于其他未经同意的用途。这有助于保护业主的个人信息权益。
- 保留证据：如果业主决定提供房产证复印件，建议保留好相关证据，如提供复印件的记录、物业的承诺或说明等。以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
总结来说，物业存档业主产权证复印件的合法性取决于具体情境。物业应确保其行为符合法律法规、基于合理服务需求且履行保密义务；而业主也应积极行使自己的知情权、投诉权和维权权，以保障自身的合法权益不受侵害。如果您在房产纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。