关于水务公司收取违约金是否合法的问题，这主要取决于几个关键因素，包括是否履行了通知义务、违约金的计算方式是否合理以及是否符合相关法律法规的规定。

首先，从通知义务的角度来看，水务公司在收取违约金之前，应当确保已经向用水人送达了缴费通知。如果水务公司未尽通知义务便开始计算欠费违约金，这可能会引发争议，因为用水人可能并未意识到自己存在欠费情况。例如，在您提供的参考信息中，就有用户反映昆明水务公司在未通知的情况下开始计算欠费违约金。

其次，违约金的计算方式也是判断其合法性的重要因素。水务公司应当明确提供违约金的计算时间、计算基数和计算利率标准。如果这些信息不透明或缺乏法律依据，那么违约金的收取就可能存在问题。如参考信息中用户所提到的，水务公司未提供这些信息，导致用户对违约金的合理性产生质疑。

再者，我们需要参考相关的法律法规。根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。这意味着，如果水务公司与用水人之间在合同中明确约定了违约金的数额和损失赔偿的计算方法，并且这些约定符合法律法规的规定，那么水务公司收取违约金就是合法的。但是，如果约定的违约金过分高于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

具体到水费欠费的情况，如果水费通知单已经发到用水人手上，并且用水人在规定的时间内（如15天内）仍然未交水费，那么供水公司根据合同约定收取违约金就是合法的。然而，如果水务公司未履行通知义务，或者违约金的计算方式不合理，那么用水人就有权对违约金的收取提出质疑。

综上所述，水务公司收取违约金是否合法，需要综合考虑通知义务是否履行、违约金的计算方式是否合理以及是否符合相关法律法规的规定。如果水务公司在这方面存在瑕疵，用水人可以通过合法途径维护自己的权益。