学校要求患有疾病的学生签署协议是否合法，需分情况讨论：

1. 协议内容合法且合理

• 若协议内容符合法律法规，且未侵犯学生合法权益，例如协议仅涉及学校对学生健康状况的知情权、必要的健康管理措施（如定期检查、提供医疗建议等），且不包含歧视性条款或不合理限制，则该协议可能是合法的。
• 法律依据：根据《民法典》第四百六十五条，依法成立的合同，受法律保护。若协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则具有法律效力。

2. 协议内容违法或不合理

• 若协议包含歧视性条款，如要求患病学生承担额外费用、限制其参加正常教学活动或毕业权利等，则该协议可能因违反《教育法》《残疾人保障法》等法律法规而无效。
• 若协议免除学校应尽的法定责任，如未提供必要的医疗支持或紧急救助措施，则可能因违反《民法典》中关于合同公平原则的规定而无效。
• 法律依据：根据《民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。同时，根据《教育法》第九条，公民依法享有平等的受教育机会，不受歧视。

3. 特殊情形：学生为未成年人

• 若学生为未成年人，学校要求其签署协议可能涉及监护人同意的问题。根据《民法典》第十九条，八周岁以上的未成年人为限制民事行为能力人，实施民事法律行为由其法定代理人代理或者经其法定代理人同意、追认。因此，若协议涉及未成年人权益，需经其法定代理人（如父母）同意，否则协议可能无效。

法律建议

1. 审查协议内容：仔细阅读协议条款，确保其不包含违法或不合理内容。
2. 咨询专业意见：若对协议内容有疑问，可向学校或教育主管部门咨询，或直接向我咨询。
3. 维护合法权益：若认为协议侵犯自身权益，可通过法律途径维护权利，如向法院提起诉讼。

总结：学校要求患病学生签署协议是否合法，需根据协议内容、学生年龄及法律法规综合判断。若协议合法合理，则具有法律效力；若违法或不合理，则可能无效。如有疑问，建议直接向我咨询，以便更全面地维护您的合法权益。