公司规定的制度是否合法，取决于其是否满足内容合法、制定程序合法以及合理性三个核心要件。
一. 内容合法
遵守法律法规：公司制度必须严格遵守《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规的强制性规定。例如，关于工作时间、加班工资、休息休假等方面的规定，均不得违反法律的明确规定。- 例如，如果公司制度规定员工每天工作超过8小时且不给付加班费，这就违反了劳动法的规定。
符合公序良俗：除了法律法规外，公司制度还应遵循社会公德和职业道德，不得违背公序良俗。例如，不能规定对员工进行人格侮辱或实施其他不道德的行为。
二. 制定程序合法
民主程序制定：涉及劳动者切身利益的规章制度，应经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。这是确保制度公正、合理的重要环节。- 例如，如果公司未经职工代表大会讨论，就单方面制定了新的薪酬制度，那么该制度的合法性就可能受到质疑。
公示或告知：公司制度制定后，必须向全体员工公示或告知，确保员工知晓并遵守。如果员工因不知情而违反制度，该制度对员工不产生法律效力。- 例如，如果公司悄悄实施了新的考勤制度，但未通知员工，那么当员工因不知新制度而违规时，公司不能据此对员工进行处罚。
三. 合理性
具有合理目的：公司制度应具有明确的合理目的，如提高工作效率、保障生产安全等。如果制度的目的不合理，或者手段与目的不相适应，那么该制度可能被视为不合法。- 例如，如果公司为了防止员工盗窃，规定所有员工下班时需接受搜身检查，这种制度就侵犯了员工的人身权利，其手段与目的不相适应，因此是不合法的。
手段与目的相适应：公司为实现某一目的所采取的手段应与其目的相适应，不得过度限制员工的权益。例如，不能为了保护商业秘密而过分限制员工的就业自由。
综上所述，公司规定的制度要合法，必须同时满足内容合法、制定程序合法以及合理性三个核心要件。如果公司有具体的制度需要咨询，请提供详细信息以便给出更准确的答复。如有进一步需要，您可以继续咨询我。