员工给自己单位讲课，其所得收入一般应认定为工资薪金，而非劳务报酬。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律定义与性质
工资薪金：根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，工资薪金是指个人因任职或者受雇而取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得。员工给自己单位讲课，通常是在其本职工作范围内或基于与单位的雇佣关系而进行的，因此所得收入应视为工资薪金的一部分。
劳务报酬：劳务报酬是指个人独立从事各种技艺、提供各项劳务取得的所得。它通常与个人提供的独立服务相关，且服务提供者与接受服务方之间不存在雇佣关系。在员工给自己单位讲课的情况下，由于员工与单位之间存在雇佣关系，因此所得收入不符合劳务报酬的定义。
二、税务处理与差异
工资薪金的税务处理：工资薪金所得在个人所得税计算中，通常作为综合所得的一部分，按照年度进行汇算清缴。员工给自己单位讲课所得的收入，应并入其当月工资薪金所得，一并计算缴纳个人所得税。
劳务报酬的税务处理：劳务报酬所得在个人所得税计算中，通常按照每次取得的收入计算应纳税所得额，并适用相应的税率和速算扣除数。如果错误地将员工给自己单位讲课所得的收入认定为劳务报酬，可能会导致税务处理上的错误和不必要的税务风险。
三、实际操作与建议
明确收入性质：单位在支付员工讲课费用时，应明确该费用的性质，即是否属于工资薪金的一部分。如果属于工资薪金，则应按照工资薪金的税务处理方式进行申报和缴纳个人所得税。
完善内部制度：单位应建立健全内部制度，明确员工讲课等类似活动的费用支付标准和税务处理方式，以避免因税务处理不当而引发的税务风险和法律纠纷。
咨询专业意见：如果单位对员工讲课所得收入的税务处理存在疑问或不确定，建议咨询专业的税务机构或律师，以确保税务处理的合规性和准确性。
总结与建议：员工给自己单位讲课所得的收入，一般应认定为工资薪金而非劳务报酬。单位在支付该费用时，应明确其性质并按照相应的税务处理方式进行申报和缴纳个人所得税。如有任何疑问或不确定，建议及时咨询专业的税务机构或律师。