在两人合伙干工程，一方签订施工合同但未签订合伙协议，且工程亏本的情况下，责任的承担需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
一、合伙关系的认定
实际合伙行为：
- 尽管未签订书面合伙协议，但如果双方存在实际的合伙行为，如共同出资、共同经营、共享收益、共担风险等，那么根据《中华人民共和国民法典》中关于合伙的规定，双方仍可能被认定为存在事实上的合伙关系。
- 在此情况下，亏本的责任应由双方共同承担，因为合伙的本质就是共同投资、共同经营、共担风险。
无合伙协议且无合伙行为：
- 如果双方既未签订书面合伙协议，也不存在实际的合伙行为，那么一方签订施工合同的行为可能被视为个人行为，与另一方无关。
- 在此情况下，亏本的责任应由签订施工合同的一方自行承担。
二、施工合同的效力与责任
合同相对性：
- 施工合同是签订合同的一方与发包方之间的法律关系，根据合同的相对性原则，合同的权利义务仅约束合同双方。
- 如果亏本是由于施工合同履行过程中的问题导致的，如成本超支、工程质量问题等，那么责任应由签订施工合同的一方承担，除非另一方存在过错或违约行为。
表见代理或职务行为：
- 如果签订施工合同的一方在签订合同时，另一方明知且未表示反对，或者根据行业惯例、交易习惯等，可以认为签订合同的一方是在代表双方行事，那么可能构成表见代理或职务行为。
- 在此情况下，亏本的责任可能由双方共同承担，但具体责任划分需根据实际情况和证据进行判断。
三、法律建议与后果
收集证据：
- 无论是否存在书面合伙协议，双方都应积极收集证据，如出资凭证、经营记录、通信记录等，以证明或反驳合伙关系的存在。
协商解决：
- 在发生亏本后，双方应首先尝试通过协商解决责任承担问题，以避免不必要的法律纠纷和成本。
法律途径：
- 如果协商无果，双方可以通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
- 在此过程中，法院或仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定，判断合伙关系的存在与否以及责任的具体承担方式。
后续行动建议：如果您或对方对责任承担有异议，建议立即咨询专业律师（即我本人，郭劲律师，专注于保险理赔、建设工程领域），并准备相关证据材料，以便在法律程序中维护自己的合法权益。