在共同犯罪案件中，如果其中有人未到案，这并不会阻碍司法机关对已到案犯罪嫌疑人的处理流程。以下是对此问题的详细解答：
一、已到案犯罪嫌疑人的处理
侦查与起诉： 司法机关会首先针对已到案的犯罪嫌疑人展开侦查工作，收集各类证据，包括物证、人证、电子数据等。只要依据现有的证据，能够清晰地证明已到案人员的犯罪事实是清楚的，并且证据是确实充分的，司法机关就会按照法律规定对其提起诉讼。
审判与定罪： 法院将依据现有证据对已到案犯罪嫌疑人的犯罪行为、责任认定等进行审理和裁决。在共同犯罪中，各犯罪嫌疑人的责任认定基于其在犯罪过程中的行为、作用等因素，如主犯、从犯、胁从犯等。只要证据确凿，法院就会依法对其定罪量刑。
二、未到案犯罪嫌疑人的追捕
追捕措施： 对于未到案的犯罪嫌疑人，司法机关会采取相应的措施进行追捕，比如发布通缉令、利用侦查技术手段等，力求将其抓获归案。
证据补充： 在追捕过程中，公安机关会围绕未到案人员的犯罪事实，不断补充和完善证据，为后续的有效指控做准备。
三、责任认定与量刑的考量
共同犯罪责任划分： 共同犯罪中各犯罪嫌疑人的责任认定是独立的，不因其他嫌疑人到案情况受影响。即使一人未到案，已到案犯罪嫌疑人的责任仍根据其具体表现确定。
量刑影响： 量刑时，法院会综合考虑整个共同犯罪的情节及已到案犯罪嫌疑人的具体情况。未到案人员行为若与已到案人员量刑关联，如犯罪分工、所得分配等，在证据查实的情况下，将在量刑时予以考量。但总体上，不会因未到案人员而影响对已到案人员的定罪和量刑。
四、后续处理与被害人权益保障
并案处理可能性： 未到案犯罪嫌疑人被抓获后，若案件事实关联紧密、证据相互印证且符合并案条件，司法机关可能将其与之前已审判的案件并案处理。但之前审判若已生效且无重大错误，通常不会轻易改变已作出的判决结果。
被害人权益保障： 在共同犯罪一人未到案情况下，也应充分保障被害人合法权益。已到案犯罪嫌疑人应依法承担民事赔偿等责任，不能因部分人员未到案而影响被害人获得应有赔偿。司法机关有义务及时告知被害人及其家属案件进展情况。
五、总体原则
处理共同犯罪案件时，司法机关严格遵守相关法律法规和程序规定，确保案件的公正、公平和合法。每个犯罪嫌疑人的责任独立，不因其他嫌疑人到案情况受影响。司法机关会全力追捕未到案人员，待其归案后与已到案人员一并处理，以此来保证共同犯罪能够得到全面且公正的惩治。
综上所述，即使共同犯罪案件中有人未到案，司法机关也能依法有序地推进案件处理，确保司法公正和效率，同时保障被害人的合法权益。