您好，针对您提出的“母亲可以将共同财产中的份额指定给未成年孩子吗？母亲死后，父亲作为监护人可以如何处理？”这一问题，我将结合相关法律知识和实际案例，为您进行详细解答。
首先，母亲确实有权在遗嘱中指定将共同财产中的个人份额赠予未成年子女。共同财产，如夫妻共有的房产，在母亲去世后，其享有的份额将作为遗产进行分配。母亲可以通过遗嘱的方式，明确这部分遗产由未成年子女继承。这是符合我国《继承法》及相关法律规定的。
接下来，关于母亲死后，父亲作为监护人应如何处理的问题，我们需要分情况讨论：
如果母亲在遗嘱中指定了未成年子女为遗产继承人：
- 父亲作为监护人，有义务保护被监护人（即未成年子女）的财产权益。
- 父亲应协助未成年子女办理遗产继承手续，确保遗产顺利过户到子女名下。
- 在子女未成年期间，父亲作为法定监护人，可以代为管理这部分遗产，但不得擅自处分，除非是为了子女的利益。
如果母亲未留下遗嘱，遗产将按照法定继承顺序分配：
- 在这种情况下，未成年子女作为第一顺序继承人，有权继承母亲的遗产份额。
- 父亲同样作为监护人，需要保护子女的继承权，并协助办理继承手续。
关于遗产的管理和使用：
- 无论遗产是通过遗嘱继承还是法定继承获得，父亲作为监护人，都应谨慎管理遗产，确保其用于子女的成长和生活需要。
- 如果遗产是房产等不易变现的资产，父亲可以考虑在子女成年前保持其原状，或根据实际情况进行合理利用（如出租），但收益应归子女所有。
- 父亲不得将遗产用于个人消费或投资，除非是为了子女的利益且经过合法程序。
特殊情况下的处理：
- 如果父亲作为监护人存在虐待、遗弃子女或严重损害子女利益的行为，其他有监护资格的人或单位可以向法院申请撤销其监护人资格，并另行指定监护人。
- 在某些情况下，如子女患有严重疾病或残疾，需要长期治疗和照顾，父亲作为监护人可以寻求社会救助或法律援助，以确保子女的权益得到充分保障。
实际案例参考：
- 以湖北省十堰市张湾区人民法院审理的被继承人债务清偿纠纷案为例，法院在判决中充分考虑了未成年子女的利益，为其保留了必要的遗产份额。这体现了法律对未成年人权益的保护。
- 另一个案例中，方先生夫妇为智力残疾的女儿制定了详细的法律方案，包括申请宣告女儿为无民事行为能力人、办理委托监护公证、订立遗嘱等，以确保女儿在父母去世后得到妥善照顾和财产管理。
综上所述，母亲可以将共同财产中的份额指定给未成年子女，父亲作为监护人应依法保护子女的财产权益，并谨慎管理遗产。如有需要，可以寻求专业法律机构的帮助，以确保子女的权益得到充分保障。