在审查起诉阶段，如果犯罪嫌疑人因住院而无法正常参与诉讼程序，这确实是一个需要特殊处理的情况。根据最高人民检察院的相关批复及专家解答，我们可以从以下几个方面来详细解答您的问题：
一、住院对审查起诉程序的影响
当犯罪嫌疑人因住院无法接受讯问或参与诉讼活动时，这可能会影响到审查起诉程序的正常进行。但根据法律规定，人民检察院在办理此类案件时，应当严格依照法律规定的期限办结，并确保犯罪嫌疑人的合法权益得到保障。
二、具体处理措施
变更强制措施：
- 如果犯罪嫌疑人因住院而丧失诉讼行为能力，无法接受讯问，人民检察院可以依法变更强制措施。例如，对于实施暴力行为的精神病人，人民检察院可以商请公安机关采取临时的保护性约束措施，以确保其安全并防止其再犯罪。
鉴定与不起诉决定：
- 经鉴定，如果犯罪嫌疑人确实系依法不负刑事责任的精神病人，人民检察院应当作出绝对不起诉决定。同时，如果犯罪嫌疑人有继续危害社会的可能，人民检察院还应当向人民法院提出强制医疗的申请。
提起公诉与中止审理：
- 对于有证据证明患有精神病的犯罪嫌疑人尚未完全丧失辨认或者控制自己行为的能力，或者患有间歇性精神病的犯罪嫌疑人实施犯罪行为时精神正常，且符合起诉条件的，人民检察院可以依法提起公诉。
- 在审判过程中，如果被告人（即原犯罪嫌疑人）因住院等严重疾病无法出庭，法院可以中止审理。如果中止审理超过六个月，被告人仍无法出庭，且被告人及其法定代理人、近亲属申请或者同意恢复审理的，法院可以在被告人不出庭的情况下缺席审理，并依法作出判决。
退回补充侦查：
- 如果案件事实不清、证据不足，人民检察院可以根据刑事诉讼法的相关规定退回侦查机关补充侦查。对于二次补充侦查后仍然认为证据不足、不符合起诉条件的案件，人民检察院应当作出（存疑）不起诉决定。
三、建议与协调
- 及时汇报与协调：为保证案件的诉讼进程，承办人应及时向部门负责人及分管院领导进行汇报，并与公安机关、法院做好协调工作，确保案件能够得到妥善处理。
- 关注犯罪嫌疑人状况：在犯罪嫌疑人住院期间，人民检察院应关注其健康状况和诉讼能力变化，以便及时调整处理措施。
四、注意事项
- 保障合法权益：在整个处理过程中，人民检察院应始终保障犯罪嫌疑人的合法权益，确保其不受非法侵害。
- 遵循法定程序：所有处理措施都应严格遵循法定程序进行，确保案件的公正性和合法性。
综上所述，当犯罪嫌疑人在审查起诉阶段住院时，人民检察院应根据其具体情况和法律规定采取相应的处理措施，以确保案件的顺利进行和犯罪嫌疑人的合法权益得到保障。