休病假两个月通常不会直接影响13个月工资（通常指年终奖或年终一次性奖金）的发放，但具体是否影响需依据单位规章制度及劳动合同的约定。以下是对此问题的详细分析：
一、不影响13个月工资的情况
单位规章制度或劳动合同有明确利好规定：
- 若单位规章制度或劳动合同中明确规定，13个月工资的发放仅与员工是否在本年度内正常提供了基本劳动服务及满足出勤的最低天数要求相关，且员工病假天数未超过该最低出勤天数限制，则病假不会影响13个月工资的发放。例如，某些单位可能规定，只要员工全年出勤天数达到一定标准（如满9个月），即可全额享受13个月工资，而不受短期病假的影响。
法律规定的合理医疗期内：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需停止工作医疗时，可享受三个月到二十四个月的医疗期。在此合理医疗期内，单位不得随意剥夺员工获得正常劳动报酬及相关福利的权利，包括13个月工资。这意味着，如果员工因病休假两个月且处于医疗期内，单位应正常发放13个月工资。
二、可能影响13个月工资的情况
单位规章制度有明确限制：
- 若单位规章制度中明确规定，病假达到一定天数会减少或取消13个月工资的发放，并且该规章制度已通过合法程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论等民主程序），并已向员工公示，则在员工病假天数超过规定限度时，13个月工资将受影响。例如，某些单位可能规定，病假超过一个月将扣除部分或全部13个月工资。
基于公平合理原则考量：
- 即便规章制度或劳动合同中未明确规定病假对13个月工资的影响，若员工病假时间过长，导致其对单位的年度贡献明显低于其他正常出勤的员工，单位从公平合理的角度出发，可能会适当减少其13个月工资的发放金额。但此时，单位需有合理的评估标准和依据，并应事先告知员工，以避免引发劳动争议。
三、建议与提醒
- 员工方面：在入职时应仔细阅读并了解单位的规章制度及劳动合同中关于薪酬福利的约定，特别是关于13个月工资及病假的相关规定。如对单位关于13个月工资的处理方式有疑问或不满，可与单位的人事或财务部门进行沟通协商，或直接向我咨询以维护自己的合法权益。
- 单位方面：在制定规章制度时，应确保其内容合法、合理且透明，并严格按照规定执行。特别是在涉及员工切身利益的条款上，如13个月工资的发放条件、病假的影响等，应充分征求员工意见，并通过合法程序进行制定和公示，以避免引发不必要的劳动争议。
总之，休病假两个月是否会影响13个月工资的发放，需根据单位规章制度、劳动合同以及相关法律法规进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。