针对您提出的“签订合同的主体与开票单位不一致如何确定被告法院判决”的问题，这确实是一个涉及合同法和民事诉讼法的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，合同签订主体与开票单位不一致，并不直接决定被告的确定或法院的判决结果。这主要取决于合同的具体内容、双方的权利义务关系以及实际履行情况。
一、合同签订主体与开票单位不一致的情况分析
不当得利情况：
- 如果收款单位（开票单位）并非合同中的当事人一方，但其却收取了合同款项，那么这种收款行为可能构成不当得利。
- 在此情况下，合同的另一方（即实际应收款方）有权主张不当得利返还，并可能将开票单位作为被告提起诉讼。
权利转让情况：
- 如果合同中享有收款权利的一方将自己的权利转让给了开票单位，但未经通知合同另一方，那么这种转让对合同另一方不发生效力。
- 在此情况下，如果合同另一方因不知情而向原收款方履行了付款义务，其仍有权向原收款方主张权利，而开票单位可能因未合法取得收款权利而面临法律风险。但此时，被告的确定可能更侧重于原收款方或双方，具体需根据案件事实和法律规定来判断。
二、被告的确定
- 在民事诉讼中，被告的确定主要依据原告的诉讼请求和案件事实。
- 如果原告认为开票单位的不当收款行为损害了其合法权益，那么原告可以将开票单位作为被告提起诉讼。
- 同时，如果合同签订主体与开票单位之间存在某种法律关系（如代理、委托等），且这种关系影响了合同的履行或权利义务的分配，那么合同签订主体也可能成为共同被告或相关被告。
三、法院的判决
- 法院的判决将基于案件事实、法律规定以及双方提交的证据来作出。
- 如果法院认定开票单位的不当收款行为构成不当得利，那么法院可能会判决开票单位返还不当得利款项。
- 如果法院认定合同签订主体与开票单位之间存在某种法律关系，且这种关系影响了合同的履行，那么法院可能会根据具体情况判决双方承担相应的法律责任。
四、建议
- 在遇到此类问题时，建议您首先收集并整理相关证据，包括合同文本、开票记录、付款凭证等。
- 然后，咨询专业律师以获取更具体的法律建议和诉讼策略。
- 最后，根据律师的建议和案件事实，决定是否提起诉讼以及如何确定被告。
综上所述，签订合同的主体与开票单位不一致时，被告的确定和法院的判决将取决于案件的具体事实和法律规定。因此，在处理此类问题时，建议您务必谨慎并寻求专业法律帮助。