员工通过电子邮件提出离职是合法的，但需满足一定条件。以下是对此问题的详细分析：
一、电子邮件辞职的合法性基础
书面形式的要求：
- 根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这里的“书面形式”并不仅限于传统的纸质文件，而是包括合同书、信件和数据电文（如电子邮件）等可以有形地表现所载内容的形式。因此，电子邮件作为数据电文的一种，符合书面形式的要求。
电子邮件的证据效力：
- 电子邮件作为即时通讯的一种形式，具有证据特点中的“关联性”。通过技术手段获取，或者通过公证机关对电子邮件内容及源代码等进行公证取证，电子邮件就具备了证据的“客观性”与“合法性”。具备了“三性”（真实性、合法性、关联性）的证据在法律上具备合法效力，也可以在诉讼中作为证据使用。
二、电子邮件辞职的注意事项
确保邮件的真实性和完整性：
- 员工在发送辞职邮件时，应确保邮件内容真实、准确，且未经过篡改。同时，邮件应包含发件人、收件人、发件和收件时间、邮件内容等关键信息，以便在需要时作为证据使用。
用人单位的确认和补强：
- 用人单位在收到员工的辞职邮件后，应及时进行回复确认，并通过电话（录音）、书面通知等方式进行补强，以确保辞职行为的合法性和有效性。
公证和留存证据：
- 为了增强电子邮件的证据效力，员工和用人单位都可以考虑对邮件进行公证。如果无法进行公证，则应在当庭演示时确保邮件内容的完整性和真实性。同时，双方都应做好证据的留存工作，以备不时之需。
三、可能存在的风险及应对措施
邮件被忽略或拒绝的风险：
- 如果用人单位忽略或拒绝员工的辞职邮件，员工可以采取进一步措施，如再次发送邮件、电话沟通或提交书面辞职申请等，以确保辞职行为的合法性和有效性。
邮件内容争议的风险：
- 如果邮件内容存在争议，如辞职原因、离职时间等，双方应通过协商或法律途径解决争议。在此过程中，电子邮件作为证据将发挥重要作用。
建议：员工在通过电子邮件提出离职时，应确保邮件内容真实、准确，并保留好相关证据。同时，用人单位在收到辞职邮件后，也应及时进行回复确认，并做好证据的留存工作。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。