孩子母亲在一般情况下不可以直接拒绝孩子父亲提交的亲子鉴定申请，但存在特定情形时，母亲有权拒绝或提出异议。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律对亲子鉴定申请的一般规定
在离婚后抚养费纠纷中，若一方申请降低抚养费，并同时提出亲子鉴定申请，这通常是为了证明孩子与申请方之间不存在生物学上的亲子关系，从而作为降低抚养费的依据。然而，法律并未直接赋予一方单方面强制进行亲子鉴定的权利。亲子鉴定的进行，一般需要双方的同意或法院的裁定。
二、孩子母亲可以拒绝亲子鉴定申请的情形
缺乏合理理由：
- 如果孩子父亲仅凭主观猜测或无充分证据就提出亲子鉴定申请，孩子母亲有权拒绝。因为亲子鉴定涉及个人隐私和家庭关系，不应被随意用于解决纠纷。
侵犯孩子权益：
- 亲子鉴定可能对孩子造成心理上的伤害，尤其是当孩子已经对家庭关系有了稳定的认知时。如果鉴定可能对孩子产生不利影响，孩子母亲可以基于保护孩子权益的考虑拒绝鉴定。
法院未裁定强制鉴定：
- 在没有法院明确裁定强制进行亲子鉴定的情况下，孩子母亲有权拒绝。因为亲子鉴定不是解决抚养费纠纷的必经程序，法院会根据具体情况判断是否需要鉴定。
三、孩子母亲拒绝亲子鉴定申请后的法律后果
法院可能根据现有证据判决：
- 如果孩子母亲拒绝亲子鉴定，且孩子父亲无法提供其他充分证据证明其与孩子之间不存在亲子关系，法院可能会根据现有证据（如出生证明、户口本等）来认定亲子关系，并据此判决抚养费问题。
孩子父亲可能承担不利后果：
- 在某些情况下，如果孩子父亲无法提供充分证据且拒绝接受其他调解方式，法院可能会认为其未尽到举证责任，从而对其不利。
四、建议与注意事项
保持冷静与理性：
- 面对此类纠纷，双方应保持冷静与理性，通过协商或法律途径解决争议，避免对孩子造成不必要的伤害。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。虽然我不能直接提供联系方式，但您可以直接向我提问，我会根据您的具体情况给出专业的法律意见。
关注孩子感受：
- 在整个过程中，应始终关注孩子的感受和需求，确保其权益得到充分保护。
总结来说，孩子母亲在一般情况下不可以直接拒绝孩子父亲提交的亲子鉴定申请，但在缺乏合理理由、侵犯孩子权益或法院未裁定强制鉴定等情形下，母亲有权拒绝或提出异议。面对此类纠纷，建议双方保持冷静与理性，通过协商或法律途径解决争议，并始终关注孩子的感受和需求。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我提问。