针对您提出的“行政案件发现超过两年怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，行政违法行为超过一定期限是否予以处罚，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要综合考虑违法行为的性质、危害后果以及法律的具体规定。

一、一般规定

根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，对于大多数行政违法行为，如果其在二年内未被发现，那么之后通常就不再给予行政处罚。这里的“二年”期限，是从违法行为发生之日开始计算的；如果违法行为具有连续或继续状态，那么期限就从行为终了之日起计算。这一规定的主要目的，是确保行政处罚的及时性和有效性，避免因为长时间追溯而带来的不公平。

二、特殊情形的追诉时效延长

当然，也存在一些例外情况。特别是当违法行为涉及公民生命健康安全、金融安全，并且造成了危害后果时，上述的二年期限将会延长至五年。这意味着，对于这类特别严重的违法行为，只有在五年内未被发现，行政机关才不能再给予行政处罚。这一规定，体现了法律对特别严重违法行为的严厉打击，以及对公众利益的重点保护。

三、不予处罚的其他情形

除了超过追诉时效之外，还有一些其他情形也可能导致行政违法行为不予处罚。比如，如果违法行为轻微，并且当事人及时改正，同时没有造成危害后果，那么行政机关将不予行政处罚。另外，如果当事人有充分证据证明其没有主观过错，那么也将免于行政处罚（但需注意，法律、行政法规另有规定的除外）。此外，对于不满十四周岁的未成年人，以及不能辨认或控制自己行为的精神病人、智力残疾人，他们的违法行为也将不予行政处罚，而是会责令监护人进行管教或看管和治疗。

四、行政机关的义务与教育作用

最后，需要强调的是，对于依法不予行政处罚的当事人，行政机关并非简单地“放过”。相反，行政机关有义务履行教育职责，通过引导和教育，促使当事人遵守法律法规，防止再次发生违法行为。这既体现了法律的宽容与人性化，也强调了法律的教育和预防功能。

综上所述，行政案件发现超过两年如何处理，是一个需要综合考虑多方面因素的问题。在处理这类案件时，我们既要遵循法律的一般规定，也要关注特殊情形的追诉时效延长，以及不予处罚的其他情形。同时，行政机关在处理不予处罚的案件时，也应注重教育和预防，以实现法律效果与社会效果的统一。