若事故复核认定存在事实不清、适用法律错误或调查及认定违反法定程序的情况，上级公安机关交通管理部门会作出责令原办案单位重新调查、认定的复核结论。具体来说，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、复核结论的种类

根据《道路交通事故处理程序规定》第七十六条，上一级公安机关交通管理部门在复核后，可能会作出以下两种结论之一：

1. 维持原认定：如果上一级公安机关交通管理部门认为原道路交通事故认定事实清楚、证据确实充分、适用法律正确、责任划分公正、程序合法，那么会作出维持原道路交通事故认定的复核结论。

2. 责令重新调查、认定：如果上一级公安机关交通管理部门认为原道路交通事故认定存在事实不清、主要证据不足、适用法律错误、责任划分不公正或调查及认定违反法定程序可能影响道路交通事故认定的情形，那么会作出责令原办案单位重新调查、认定的复核结论。

二、重新调查、认定的流程

当上一级公安机关交通管理部门作出责令重新调查、认定的复核结论后，原办案单位需要在十日内依照规定重新调查，并重新制作道路交通事故认定书，同时撤销原道路交通事故认定书。这一流程确保了事故认定的准确性和公正性，避免了因原认定存在错误而导致的不公平结果。

三、对当事人的影响及应对建议

1. 对当事人的影响：

   • 如果原认定被维持，那么当事人需要接受这一结果，并按照认定书中的责任划分承担相应的法律责任。
   • 如果原认定被责令重新调查、认定，那么当事人需要等待新的认定书出具，并根据新的认定结果承担相应的法律责任。这可能导致责任划分的变更，进而影响当事人的赔偿等权益。

2. 应对建议：

   • 积极收集证据：无论原认定是否被维持或重新调查，当事人都应积极收集与事故相关的证据，如现场勘查资料、证人证言、监控录像等，以备不时之需。
   • 及时提出复核申请：如果当事人对原认定有异议，应在规定期限内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请，详细说明认为原认定不清的理由及相关证据。
   • 配合重新调查：如果原认定被责令重新调查，当事人应积极配合原办案单位的调查工作，提供必要的协助和信息。
   • 考虑司法途径：如果当事人对复核结论仍不服，可在规定期限内向法院提起行政诉讼，通过司法途径来争取公正的认定。

四、法律依据

• 《道路交通事故处理程序规定》第七十六条：明确了上一级公安机关交通管理部门在复核后可能作出的两种结论及其条件。
• 《中华人民共和国行政复议法》第二十八条：虽然主要针对行政复议，但其中关于具体行政行为认定事实清楚、证据确凿、适用依据正确、程序合法等内容的审查标准，与交通事故复核的审查标准有相似之处，可提供一定的法律参考。

综上所述，当事故复核认定存在事实不清、适用法律错误或调查及认定违反法定程序的情况时，上级公安机关交通管理部门会作出责令原办案单位重新调查、认定的复核结论。当事人应积极应对，收集证据，及时提出复核申请，并配合重新调查工作。如有需要，还可考虑通过司法途径来维护自己的合法权益。