在机动车交通事故责任纠纷案件中，关于保险公司是否能单独作为被告的问题，确实存在一些法律上的细节和实务操作上的考量。以下是对这一问题的详细解答：
首先，从法律层面来看，保险公司确实有可能单独作为被告。这主要基于以下几点法律依据：
《道路交通安全法》第七十六条：该条款明确规定，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。这实际上赋予了受害人直接以保险公司为被告提起诉讼主张赔偿的权利。
《保险法》第五十六条：该条款规定，保险人对责任保险的被保险人给第三者造成的损害，可以依照法律的规定或者合同的约定，直接向该第三者赔偿保险金。这进一步支持了受害者可以直接向保险公司起诉，并要求其支付赔偿金的权利。
然而，在实际操作中，是否将保险公司单独列为被告，还需考虑具体情况：
交强险范围内的赔付：在交强险责任限额内，保险公司承担的是直接赔偿义务，不划分责任和衡量过错程度。因此，在交强险足额赔付的情形下，允许原告撤回对实际侵权人的起诉，而仅将保险公司作为单独被告，这有利于纠纷的及时解决和维护受害人的合法权益。
商业三者险的赔付：如果事故损失超出了交强险的赔付范围，且车辆还投保了商业三者险，那么根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十三条，当事人同时起诉侵权人和保险公司的，人民法院应当依照相关法律规定确定赔偿责任。在这种情况下，将肇事人和保险公司同时列为被告可能更为合适。
肇事司机逃逸或失踪的情况：如果肇事司机逃逸或失踪，导致无法送达，那么从实务操作的角度来看，允许原告仅将保险公司作为被告可能更为实际和可行。但这也需要根据具体案件情况和法院的判断来决定。
总结与建议：
希望以上解答能够为您提供清晰、详细、有深度的指导。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。