结论：一般情况下，买卖双方核算单位不一致导致开发票时数量与合同不一致是不可以的，这种行为可能引发税务、合同履行等多方面的问题，但在特定合理情形下经妥善处理可能被认可。具体分析如下：

从税务合规角度

1. 不符合发票开具规范 根据税收相关法律法规，发票的开具应当准确反映交易的真实情况。合同中约定的数量是交易双方对交易标的数量的明确约定，发票作为记录经济业务活动的会计凭证，其数量应当与合同一致。如果因为核算单位不一致就随意改变发票数量，会导致发票信息与实际交易情况不符，违反发票开具的准确性要求。例如，合同约定以“吨”为单位交易10吨货物，而发票却以“千克”为单位开具了10000千克（1吨 = 1000千克）之外的其他数量，这显然不符合规范。
2. 可能引发税务风险 税务机关在核查企业税务情况时，会对比合同、发票以及企业的财务账目等资料。如果发现发票数量与合同不一致，且没有合理的解释和依据，可能会被认定为虚开发票或者存在其他税务违规行为。这不仅会导致企业面临补缴税款、加收滞纳金和罚款等处罚，还可能影响企业的纳税信用等级，给企业带来不必要的税务麻烦。

从合同履行角度

1. 违反合同约定 合同是双方当事人意思表示一致的协议，对双方具有法律约束力。合同中明确约定的数量是双方履行合同的重要依据。如果发票数量与合同不一致，可能会被视为未按照合同约定履行义务。例如，买方可能以发票数量与合同不符为由，认为卖方未完全履行交货义务，从而拒绝支付货款或者要求卖方承担违约责任。
2. 影响交易安全和信任 在商业交易中，合同和发票是保障交易安全和建立双方信任的重要文件。发票数量与合同不一致会破坏这种信任关系，引发双方对交易真实性和准确性的质疑。这可能会导致双方在后续的合作中产生矛盾和纠纷，影响企业的商业声誉和合作关系。

特定合理情形及处理方式

1. 存在合理换算关系且双方认可 如果买卖双方因为行业习惯或者实际需要，采用了不同的核算单位，但存在明确的、被双方认可的换算关系，并且能够在合同中或者相关补充协议中明确说明这种情况，那么在开具发票时，虽然数量表现形式与合同不一致，但实质上是符合交易真实情况的。例如，合同约定以“箱”为单位交易，每箱包含固定数量的“件”，发票以“件”为单位开具，同时在发票或者相关说明中注明了与合同“箱”数的换算关系，这种情况下是可以的。不过，为了确保合规，建议双方在交易前就核算单位和换算关系进行充分沟通并形成书面文件。
2. 及时沟通与修正 如果在开具发票后发现因为核算单位不一致导致数量与合同不符，双方应当及时沟通，说明情况。卖方可以收回原发票，重新开具与合同数量一致的发票。如果已经无法收回原发票，应当按照税务机关的规定进行处理，如开具红字发票等，以确保发票信息与合同和实际交易情况相符。