发工资只发档案工资一般是不正常的，但具体是否合法需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、档案工资与实际工资的区别
档案工资，通常指的是员工在入职时，根据其学历、资历、职位等因素确定的工资标准，它可能作为员工工资的一个基准或参考。然而，在实际操作中，员工的工资往往由多个部分组成，包括但不限于基本工资、绩效工资、奖金、津贴等。因此，档案工资并不等同于员工实际应得的工资总额。
二、只发档案工资可能存在的问题
未足额支付工资：
- 如果员工的实际工资构成中包含了绩效工资、奖金等部分，而用人单位仅发放档案工资，那么很可能存在未足额支付工资的情况。
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定的标准支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。
违反劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了工资构成及支付方式，而用人单位未按照约定执行，那么用人单位的行为就构成了违约。
影响员工权益：
- 工资是员工劳动的主要回报，也是员工生活的重要来源。如果用人单位只发档案工资，可能会影响员工的正常生活，甚至损害员工的合法权益。
三、应对措施与建议
核查劳动合同：
- 首先，员工应核查自己的劳动合同，了解其中关于工资构成及支付方式的约定。
与用人单位沟通：
- 如果发现用人单位只发档案工资，员工可以与用人单位进行沟通，了解原因并要求按照劳动合同约定支付工资。
寻求法律援助：
- 如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、特殊情况说明
- 如果劳动合同或规章制度中有明确规定：在某些特殊情况下，如果劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了工资支付方式为档案工资，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位只发档案工资可能是合法的。但这种情况较为罕见，且需要严格的条件限制。
总结与建议：
发工资只发档案工资一般是不正常的，可能涉及未足额支付工资、违反劳动合同约定等问题。员工应首先核查自己的劳动合同，了解工资构成及支付方式；如果发现问题，应及时与用人单位沟通并要求解决；如果沟通无果，可以寻求法律援助以维护自己的合法权益。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。