非法经营案中，所得是否会被没收需根据具体案件情况判断，但通常情况下，非法所得会被依法追缴或没收。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，非法经营罪是指违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的行为：

1. 未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
2. 买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
3. 未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
4. 其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。

对于构成非法经营罪的行为，法律明确规定了相应的刑罚，包括有期徒刑、拘役以及罚金或没收财产等。其中，对于情节特别严重的非法经营行为，法律明确规定了可以并处没收财产。这里的“没收财产”通常包括犯罪分子通过非法经营行为所获得的全部或部分非法所得。

二、非法所得的处理方式

1. 追缴或责令退赔：根据法律规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。在非法经营罪中，非法所得属于犯罪分子违法所得的财物范畴，因此会被依法追缴或责令退赔。
2. 没收：对于情节特别严重的非法经营行为，司法机关在查明并认定非法所得的具体数额和范围后，会依法予以没收。这旨在剥夺犯罪分子通过非法经营行为所获取的经济利益，起到惩罚犯罪、遏制违法活动的作用。

三、具体案例与量刑因素

1. 具体案例：在实际司法实践中，非法经营罪的案例多种多样，涉及的经营物品和领域也各不相同。例如，非法经营烟草、药品、外汇等行为都可能构成非法经营罪。在这些案例中，司法机关会根据案件的具体情况，包括非法所得的数额、对市场秩序的危害程度等因素，来决定是否追缴或没收非法所得。
2. 量刑因素：在量刑时，法院会综合考虑多种因素，包括非法所得的数额、犯罪情节的严重程度、犯罪分子的主观恶性、是否有自首或立功表现等。这些因素都会影响最终的刑罚决定，包括是否追缴或没收非法所得。

四、建议与注意事项

1. 及时咨询专业律师：如果您或您身边的人涉及非法经营罪，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
2. 配合司法机关调查：在案件处理过程中，应积极配合司法机关的调查和审判工作，如实陈述事实和提供证据。
3. 注意保护自身权益：在处理非法经营案件时，也应注意保护自身的合法权益，避免受到不必要的损失。