结论：在建设工程合同中，并非必须完全按照招标文件签订合同，但合同的主要条款和实质性内容应当与招标文件保持一致。

一、法律原则与规定

1. 《中华人民共和国招标投标法》的相关规定：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。这意味着，合同的内容应当基于招标文件和投标文件，但并不意味着必须逐字逐句地复制招标文件。
   • 同时，该法条也强调了合同的实质性内容应当与招标文件和中标人的投标文件相一致，这主要是为了确保合同的公平性和透明度，防止招标人和中标人在合同签订过程中进行不正当的修改。

2. 合同自由原则：

   • 在不违反法律法规和招标文件实质性要求的前提下，招标人和中标人可以在合同中约定一些额外的条款或对某些非实质性内容进行修改。这是合同自由原则的体现，也是市场经济下合同订立的常态。

二、实际操作中的注意事项

1. 实质性内容的保持：

   • 在签订合同时，必须确保合同的主要条款（如工程范围、建设工期、工程质量、工程造价等）与招标文件保持一致。这些条款是合同的核心，也是招标活动的目的所在。
   • 如果需要对这些实质性内容进行修改，必须重新进行招标或经过相关部门的批准，否则可能会面临法律风险和合同无效的风险。

2. 非实质性内容的协商：

   • 对于一些非实质性的内容（如付款方式、违约责任的具体表述等），招标人和中标人可以在合同中进行协商和修改。这些修改不会影响合同的公平性和透明度，也不会损害其他投标人的利益。
   • 在进行这些修改时，建议双方保持沟通并记录修改过程，以避免后续产生纠纷。

三、法律后果与风险提示

1. 合同无效的风险：

   • 如果合同的主要条款或实质性内容与招标文件存在重大差异，且未经相关部门批准或重新招标，那么该合同可能会被认定为无效合同。这将导致双方无法依据合同主张权利或履行义务，给双方带来不必要的损失。

2. 行政处罚与民事责任：

   • 对于违反招标投标法规定的行为，相关部门可能会对其进行行政处罚，如罚款、取消投标资格等。同时，如果因合同无效或违约行为给对方造成损失，违约方还需要承担相应的民事责任。

四、建议与措施

1. 严格审查合同内容：

   • 在签订合同时，建议双方对合同内容进行严格审查，确保合同的主要条款和实质性内容与招标文件保持一致。

2. 保留书面记录：

   • 在合同签订过程中，建议双方保留完整的书面记录，包括招标文件、投标文件、中标通知书、合同草案等。这些记录将作为后续纠纷解决的重要依据。

3. 及时咨询专业律师：

   • 如果在合同签订过程中遇到任何法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师。作为专业律师，我可以为你提供全面的法律咨询和风险评估服务。

总之，在建设工程合同中，并非必须完全按照招标文件签订合同，但必须确保合同的主要条款和实质性内容与招标文件保持一致。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。