分包单位将工程违法转包给个人，双方签订的违约条款是无效的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律强制性规定角度
根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条：“违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。”以及《中华人民共和国建筑法》第二十八条：“禁止承包单位将其承包的全部建筑工程转包给他人，禁止承包单位将其承包的全部建筑工程肢解以后以分包的名义分别转包给他人。”违法转包行为直接违反了法律的强制性规定，因此，基于该行为签订的转包协议（包括其中的违约条款）自然无效。
二、合同目的与性质角度
违法转包往往不能保证工程质量和施工安全，背离了合同应有的保障和履行目的。同时，违法转包行为背后往往隐藏着规避法律或追求不正当利益的动机，这与合同的正当性和合法性相悖。因此，从合同目的与性质的角度来看，违法转包协议（包括违约条款）也是无效的。
三、法律后果角度
合同无效：一旦违法转包协议被认定为无效，双方当事人均不能依据该协议主张权利或履行义务。这意味着，转包方不能依据违约条款要求支付转包费用或承担违约责任，而实际施工人也无权依据该协议要求承包方承担违约责任。
非法所得收缴：根据相关法律法规，人民法院有权收缴当事人因违法转包而取得的非法所得。这不仅是对违法行为的经济制裁，也是对市场秩序的一种维护。
折价补偿与工程质量：尽管转包协议无效，但如果建设工程经验收合格，实际施工人可以参照合同关于工程价款的约定请求折价补偿。然而，这并不意味着违法转包行为得到了认可，而是出于公平原则对实际施工人劳动成果的合理补偿。同时，工程质量仍然是衡量是否能否获得补偿的关键因素。如果工程质量不合格，实际施工人可能无法获得补偿，甚至需要承担修复、赔偿等责任。
四、建议与启示
为避免违法转包带来的法律风险和经济损失，分包单位应严格遵守相关法律法规，确保建筑工程分包的合法性和有效性。在实际操作中，应加强对分包单位的资质审查和合同管理，确保工程质量和施工安全。对于已经发生的违法转包行为，应及时采取措施进行整改和补救，以减轻可能的法律后果。
总结：分包单位将工程违法转包给个人，双方签订的违约条款是无效的。这不仅因为违法转包行为违反了法律的强制性规定，还因为该行为背离了合同的正当性和合法性。在实际操作中，各方应严格遵守相关法律法规，确保建筑工程分包的合法性和有效性。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。