结论：能否要回欠款，关键在于是否已过诉讼时效以及是否存在诉讼时效中断或重新计算的情形。若已过最长诉讼时效且无中断或重新计算情形，则公司可能丧失胜诉权，无法通过法律途径要回欠款；若未过时效或存在中断、重新计算情形，则公司仍有机会要回欠款。

分析：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。但需注意，存在一些特殊情况下的最长诉讼时效，如自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

2. 诉讼时效的起算与中断：

   • 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 在诉讼时效期间内，如果因权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形，导致诉讼时效中断，则从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算。

3. 针对本案例的具体分析：

   • 若自员工欠公司钱并签订赔偿协议之日起，至今已超过二十年，且在这二十年间公司从未向员工主张过权利，也未发生诉讼时效中断或重新计算的情形，那么公司可能已丧失通过法律途径要回欠款的胜诉权。
   • 若在这二十年间，公司曾向员工主张过权利（如发送催款通知、提起诉讼等），或者存在其他导致诉讼时效中断或重新计算的情形，那么公司仍有可能通过法律途径要回欠款。

4. 建议与后续行动：

   • 公司应首先审查与员工签订的赔偿协议及相关证据，确认欠款事实、金额及签订时间。
   • 接着，公司应调查在这二十年间是否曾向员工主张过权利，或者是否存在其他导致诉讼时效中断或重新计算的情形。
   • 如果公司认为仍有要回欠款的可能性，建议尽快咨询专业律师，评估法律风险及制定合适的法律策略。
   • 如果公司认为已丧失胜诉权，也可以考虑与员工进行协商，看是否能够达成和解或分期偿还等协议。

总结与提醒：在处理此类长期未决的债权债务问题时，公司应充分重视诉讼时效的规定，及时采取措施保护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。