未签股东协议，但工商注册的股权通常是有效的。不过，其有效性需根据具体情况进行细致分析和判断，以下从不同角度为您详细阐述：

一、已进行工商核准登记的情况

若双方虽未签订书面股权协议，但已经工商行政管理部门对股东身份及股权比例等情况进行了核准登记，并满足公司设立或股权变动的其他条件（如共同出资、共同经营等，具体依公司类型而定），则此股权关系可被视为有效。这是因为：

• 工商登记的法定效力：工商行政管理部门的核准登记具有法定效力，是对公司经济组织形式及股东身份的一种确认。它向外界公示了公司的股权结构，具有对外的公信力。
• 实际出资与认可：即便没有书面协议，只要股东实际履行了出资义务，并且公司认可其股东身份，同时在公司章程中有明确记载且经过工商登记，那么其股权通常是被认定为有效的。

二、未进行工商登记，但存在实质要素的情况

若既无书面股权协议又无工商登记，但在实际运营中存在股权的实质要素，如各自提供资金、实物、技术等出资，且有两个以上无利害关系人证明存在口头股权约定或股权关系的具体内容，同样可以认定双方具有股权关系。不过，这种情况下证明股权关系的难度较大，需要依赖其他证据来构建完整的证明体系，例如：

• 资金往来记录：股东之间的资金往来记录可以证明出资情况。
• 共同经营活动的凭证：如会议记录、决策文件等，可以证明股东参与了公司的共同经营。
• 合伙财产的共有情况：如公司资产登记在股东名下或股东共同享有公司资产的使用权等。
• 无利害关系人的证言：两个以上无利害关系人的证言对于证明口头股权约定或股权关系的具体内容至关重要。

三、无任何书面或有效证据的情况

如果没有任何书面或其他有效的证据来证明股权相关的事宜，那么在发生纠纷时，当事人主张股权权益将会面临极大的困难。因为缺乏确凿的证据，很难去证明相关的事实以及各方的真实意思表示，这就可能导致其权益无法得到有效的保护和支持。

法律建议

1. 签订书面协议：为了避免未来可能出现的纠纷，建议股东之间签订书面的股权协议，明确各自的权利和义务。
2. 完善工商登记：确保股权关系经过工商行政管理部门的核准登记，以获得法定的公示效力和公信力。
3. 保留相关证据：在无书面协议的情况下，应特别注意保留能够证明股权实质要件的证据，如资金往来记录、共同经营活动的凭证等。

举例说明：假设A和B口头约定共同出资设立一家有限责任公司，A出资60%，B出资40%，但未签订书面股权协议。后来公司经营良好，但A和B因分红问题产生纠纷。如果此时A和B能够提供资金往来记录、共同参与公司决策的文件以及无利害关系人的证言等证据，证明他们之间存在股权关系及具体的股权比例，那么他们的股权关系通常是可以被认定的。但如果缺乏这些证据，A和B的股权主张就可能得不到法律的支持。

总之，未签股东协议并不必然导致股权无效，关键在于是否存在股权的实质要件及外部证据支持。如果您在此方面遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。