结论前置：

1. 单位正在进行营业执照作废本身，并不直接构成申请劳动仲裁的法定理由。但若因此导致劳动权益受损，如工资拖欠、社保未缴等，则可申请劳动仲裁。
2. 申请劳动仲裁需满足法定条件，并遵循相应流程。

详细分析：

首先，我们需要明确的是，单位正在进行营业执照作废这一行为，本身并不直接构成劳动者申请劳动仲裁的法定理由。营业执照作废可能意味着单位正在进行注销、吊销或变更等程序，但这并不直接等同于单位与劳动者之间的劳动关系发生了变化，或者单位违反了与劳动者之间的劳动合同或相关法律法规。

然而，如果单位在营业执照作废的过程中，或者因为营业执照作废的原因，导致了劳动者的劳动权益受到损害，比如拖欠工资、未缴纳社会保险、违法解除劳动合同等，那么劳动者就有权根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。

申请劳动仲裁的条件和流程：

1. 申请条件：

   • 劳动者与用人单位之间存在劳动关系；
   • 劳动者认为用人单位违反了劳动合同或相关法律法规，侵害了其劳动权益；
   • 劳动者在知道或应当知道其权益被侵害之日起一年内提出申请。

2. 申请流程：

   • 准备材料：包括仲裁申请书、身份证明、与用人单位存在劳动关系的证明材料（如劳动合同、工资单、工作证等）、以及相关证据材料（如拖欠工资的凭证、未缴纳社保的证明等）。
   • 提交申请：将准备好的材料提交至用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会。
   • 受理与开庭：仲裁委员会在收到申请后，会进行审查并决定是否受理。如果受理，会安排开庭时间，并通知双方当事人。
   • 裁决与执行：仲裁庭在开庭后，会根据双方提供的证据和陈述，作出裁决。如果用人单位不履行裁决，劳动者可以向人民法院申请强制执行。

特殊情况下的考虑：

如果单位正在进行营业执照作废，且这一行为直接导致了劳动者的劳动权益受到严重损害，比如单位突然停业、无法联系等，劳动者在申请劳动仲裁时，可能需要特别注意收集和保存相关证据，以证明单位的行为与其劳动权益受损之间的因果关系。同时，劳动者也可以考虑向相关部门（如工商行政管理部门）投诉或举报单位的违法行为，以维护自己的合法权益。

最后建议：

如果您因为单位正在进行营业执照作废而面临劳动权益受损的问题，建议您及时咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于劳动仲裁等领域），了解自己的权利和义务，并遵循法定程序申请劳动仲裁。同时，也要注意收集和保存相关证据，以支持自己的主张。