宅基地转让协议书超过20年，在符合一定条件下，仍然可以作为证据使用。以下从不同角度为您详细分析：

证据效力角度

从证据的基本属性来看，只要宅基地转让协议书是真实存在的，且其内容能够反映双方当时的真实意思表示，没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么它本身就具备证据的资格。时间的流逝，包括超过20年，并不会直接导致这份协议书失去证据效力。也就是说，只要协议书真实、合法、关联，无论经过多少年，都可以作为证据提交给法院。

诉讼时效角度

然而，我们需要考虑的是诉讼时效的问题。在民事诉讼中，一般存在诉讼时效的限制，这是为了促使权利人及时行使权利，维护社会秩序的稳定。对于宅基地纠纷而言，虽然一般的民事诉讼时效是三年，但如果从权利受到损害的那一天开始算起，超过了20年，人民法院在原则上是不会提供保护的。这并不意味着超过20年的协议书就不能作为证据，而是说，如果权利人在这20年内没有行使权利，且没有特殊情况（如不可抗力、其他障碍不能行使请求权等），那么法院可能不会支持其基于该协议书的诉讼请求。

特殊情况处理：如果存在特殊情况，比如权利人因为某些原因（如长期在外地、生病等）无法及时行使权利，且这些原因构成了诉讼时效中止或中断的法定事由，那么权利人可以在这些事由消除后的一定时间内（通常是诉讼时效期间剩余时间内或重新计算诉讼时效期间）行使权利。此时，即使协议书已经超过20年，仍然可以作为证据使用，并且有可能得到法院的支持。

实际操作建议

1. 保存好协议书原件：无论时间过去多久，协议书原件都是最重要的证据。因此，一定要妥善保管，避免丢失或损坏。
2. 收集其他相关证据：除了协议书本身，还可以收集其他与宅基地转让相关的证据，如付款凭证、证人证言等，以形成完整的证据链。
3. 及时咨询律师：如果涉及到宅基地纠纷，且时间已经超过20年，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况，为您提供专业的法律意见和诉讼策略。

案例参考：在实际操作中，也有超过20年的宅基地转让协议书被法院采纳作为证据的案例。这些案例通常都涉及到了特殊情况的处理，比如权利人因为某些原因无法及时行使权利，且这些原因构成了诉讼时效中止或中断的法定事由。

综上所述，宅基地转让协议书超过20年，在符合一定条件下（如真实、合法、关联，且存在特殊情况导致诉讼时效中止或中断），仍然可以作为证据使用。但具体能否得到法院的支持，还需要根据案件的具体事实和证据来进行判断。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。