当规范性文件被废止时，其处理方式及后续影响需依据相关法律法规和政策要求来明确。以下是对规范性文件废止后如何处理的详细解答：

一、废止文件的确定与通知

1. 确定废止文件：

   • 政府部门会依据《国务院办公厅关于加强行政规范性文件制定和监督管理工作的通知》等文件要求，对现行行政规范性文件进行全面清理。
   • 清理过程中，会识别出那些已被新文件替代、阶段性任务已完成、适用期已过、文件内容已过时或调整对象已消失的文件，作为废止对象。

2. 发布废止通知：

   • 政府部门会发布正式通知，如“关于废止部分行政规范性文件的通知”，明确列出被废止的文件名称、文号及废止日期。
   • 通知中会强调，自通知印发之日起，被废止的文件一律停止执行，不再作为行政管理的依据。

二、废止文件后的处理措施

1. 停止执行与不再引用：

   • 被废止的文件自废止通知印发之日起，立即停止执行。
   • 政府部门、企事业单位及个人在行政管理、业务操作或法律诉讼中，不得再引用被废止的文件作为依据。

2. 文件归档与保存：

   • 虽然文件被废止，但出于历史记录、法律追溯或研究需要，相关部门可能会将被废止的文件进行归档保存。
   • 归档的文件应注明废止日期及废止原因，以便后续查阅和参考。

3. 替代文件的制定与实施：

   • 对于被废止的文件中涉及的重要管理事项或业务操作，政府部门通常会制定新的规范性文件来替代。
   • 新的文件会明确管理要求、操作流程及法律责任，确保行政管理的连续性和有效性。

三、对相关方的影响与应对

1. 对政府部门的影响：

   • 政府部门需要更新内部管理制度和操作流程，确保与新文件保持一致。
   • 同时，加强对新文件的宣传和培训，提高工作人员对新规定的理解和执行能力。

2. 对企事业单位及个人的影响：

   • 企事业单位及个人需要关注政府部门发布的废止通知和新文件，及时调整自身的业务操作和管理方式。
   • 对于因文件废止而可能产生的法律纠纷或经济损失，应及时咨询法律专业人士，寻求合法合理的解决方案。

四、案例参考

以北京市城市管理委员会为例，该部门曾发布通知，决定废止存在已被新文件替代、阶段性任务已完成等情形的40件行政规范性文件。这些文件自通知印发之日起一律停止执行，不再作为行政管理的依据。同时，该部门也强调了新文件的制定和实施，以确保行政管理的连续性和有效性。

综上所述，当规范性文件被废止时，政府部门会发布正式通知明确废止事项，并采取停止执行、归档保存及制定替代文件等措施。相关方应关注废止通知和新文件，及时调整自身的业务操作和管理方式，以适应新的管理要求。