招标流标后直接指定投标人通常是不合法的。以下是对这一结论的详细解释：
法律背景
在招标活动中，流标指的是因投标人数不足、投标报价均超出预算或其他法定原因，导致招标未能成功的情况。对于流标后的处理，应当遵循公开、公平、公正的原则，以及相关的法律法规和招标文件的规定。
不合法的原因
违反公开、公平、公正原则：
- 招标活动的核心目的是通过竞争性的方式选择最优的投标人。直接指定投标人将剥夺其他潜在投标人的竞争机会，违反招标活动的公开、公平、公正原则。
违反法律法规：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规，招标人在招标过程中应当遵循法定的程序和要求，不得擅自改变招标方式或直接指定投标人。直接指定投标人可能构成对法律法规的违反。
损害公共利益和招标人利益：
- 直接指定投标人可能导致项目质量、价格等方面无法得到有效控制，从而损害公共利益和招标人的利益。通过竞争性的招标方式，可以更有效地确保项目的质量和价格符合市场预期。
合法处理方式
重新招标：
- 在流标后，招标人可以选择重新发布招标公告，吸引更多的投标人参与竞争。这是最直接且符合法律法规的处理方式。
分析流标原因并调整招标条件：
- 招标人可以分析流标的原因，如招标条件过于苛刻、预算不合理等，并据此调整招标条件，以吸引更多的投标人。
寻求专业咨询：
- 在处理流标问题时，招标人可以寻求专业律师或招标代理机构的咨询，以确保处理方式的合法性和有效性。
综上所述，招标流标后直接指定投标人通常是不合法的，应当遵循法律法规和招标文件的规定，通过重新招标或其他合法方式处理流标问题。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。