桩基工程单独发包不合法。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

法律依据角度

根据《建筑法》第二十九条的规定，建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。同时，施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。桩基工程作为地基与基础分部的子分部工程，其资质归属在地基基础施工作业之范畴内，按照相关法规，它并不能由建设方肢解独立发包，而应由总承包单位合法分包给具备专业资质的专业队伍施工。此外，《建设工程质量管理条例》第七条也明确规定，建设单位应当将工程发包给具有相应资质等级的单位，且不得将建设工程肢解发包。

资质要求角度

桩基工程需要专业的施工技术和资质。只有具备与签订该项工作对应的资质条件的企业，方能有资格承担此部分的工程承包任务。如果建设单位试图将桩基工程单独发包给不具备相应资质条件的单位，不仅违反了法律法规，还可能对工程质量造成严重影响。

法律后果角度

如果建设单位违反规定，将桩基工程单独发包，可能会面临一系列的法律后果。这包括但不限于：被责令改正，处以罚款；如果因此造成工程质量问题或安全事故，还可能承担相应的民事赔偿责任，甚至刑事责任。同时，总承包单位和分包单位就分包工程对建设单位承担连带责任，如果分包单位不具备相应资质条件，总承包单位也可能因此受到牵连。

建议与提醒：

• 在进行建设工程发包时，建设单位应严格遵守相关法律法规，确保发包行为的合法性。
• 如果需要发包桩基工程等专项工程，应通过总承包单位进行合法分包，并确保分包单位具备相应的资质条件。
• 在签订合同时，应明确各方的权利义务和责任划分，以避免后续纠纷的发生。

如果有任何关于建设工程发包、分包或合同纠纷等方面的法律问题，可以直接向我咨询。