离职原因经公司修改后的生效时间，主要取决于修改后的离职原因是否已被双方确认，以及是否符合相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 双方确认的情况：

   • 如果公司修改离职原因后，与员工进行了充分沟通，并得到了员工的明确确认（如通过书面形式签署确认文件），那么修改后的离职原因自双方确认之日起生效。
   • 在此情况下，生效时间明确，且双方均应遵守确认后的离职原因及相关约定。

2. 未获员工确认的情况：

   • 如果公司单方面修改了离职原因，且未获得员工的确认，那么修改后的离职原因可能不会立即生效。
   • 员工有权对未经其同意的离职原因提出异议，并可能要求公司恢复原离职原因或进行进一步协商。
   • 在此情况下，生效时间将取决于双方协商的结果或法律程序的进展。

3. 法律法规的考量：

   • 离职原因的修改必须符合相关法律法规的规定，如《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等。
   • 如果修改后的离职原因违反了法律法规的强制性规定（如歧视性离职原因、违法解除劳动合同等），那么该修改将无效，且可能面临法律责任。
   • 在此情况下，生效时间将不受公司单方面意愿的影响，而是由法律程序决定。

法律建议：

• 对于公司而言，在修改离职原因前，应与员工进行充分沟通，并尽量取得员工的书面确认，以避免后续纠纷。
• 对于员工而言，如果发现公司单方面修改了离职原因，且未获得自己的确认，应及时与公司沟通并表达异议。如果沟通无果，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果公司未经员工同意单方面修改离职原因，并导致员工权益受损，员工有权要求公司承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复原状等。
• 如果修改后的离职原因违反了法律法规的强制性规定，公司可能面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。

综上所述，离职原因经公司修改后的生效时间并非固定不变，而是取决于多种因素的综合考量。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。