在没有全勤奖的情况下，公司因迟到扣工资是否合理，主要取决于用人单位的规章制度是否合法制定并公示、劳动合同是否有相关约定，以及扣薪是否符合法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规视角
用人单位扣薪的合法性：
- 根据我国劳动法规，用人单位不得无故克扣员工工资。任何扣薪行为都应有明确的法律依据或合同约定，否则将被视为违法行为。
经济损失与扣薪关系：
- 根据《工资支付暂行规定》，若劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失，且用人单位能提供明确证明，则可按合同约定要求劳动者赔偿，但每月扣除的工资不得超过其当月工资的20%。然而，这一规定并不直接适用于迟到扣工资的情况，除非迟到行为直接导致了经济损失，并且用人单位能够证明这一点。
二、用人单位规章制度与劳动合同视角
规章制度的制定与公示：
- 若用人单位依法制定了规章制度，明确规定了迟到属于违纪行为及相应的扣薪标准，并且该规章制度经过了民主程序（如职工代表大会讨论、工会协商等）制定，并已向劳动者公示（如发放员工手册、组织培训学习等），则因迟到扣工资是合理合法的。
劳动合同的约定：
- 若劳动合同中明确约定了迟到扣工资的标准和方式，且不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣薪行为也具有合理性。但需要注意的是，劳动合同中的约定不能违反法律法规的强制性规定，否则该约定将无效。
三、不合理或违法的扣薪情况
缺乏制度依据：
- 若用人单位没有相关规章制度，或规章制度未依法定程序制定和公示，随意以迟到为由扣工资，这是不合理且不合法的。
扣薪标准过高：
- 即便有规章制度规定迟到扣工资，但若扣薪标准明显过高，导致劳动者的实际收入严重受损，甚至低于当地最低工资标准，这种扣薪也是不合理的。
无法证明经济损失：
- 若用人单位无法提供因员工迟到导致的经济损失的证明，仅仅因为员工迟到就扣工资，这种做法同样是不合理的。
四、劳动者权益保护
- 面对不合理的扣工资行为，劳动者应首先与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣薪依据和理由。
- 若协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，劳动者还可以提起诉讼来寻求法律救济。
总结与建议：
- 在没有全勤奖的情况下，公司因迟到扣工资是否合理，需要综合考虑用人单位的规章制度、劳动合同以及相关法律法规的规定。
- 若规章制度和劳动合同均有明确规定，且扣薪行为符合法规要求，则扣工资可能是合理的；反之，则可能不合理甚至违法。
- 劳动者在面对不合理的扣工资行为时，应积极维护自己的合法权益，通过沟通协商、投诉或申请劳动仲裁等方式来解决问题。
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