员工自动离职（自离）后，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资。以下是关于自离后工资结算的详细解析：
一、工资计算与结算标准
按实际工作天数计算：
- 用人单位应根据员工实际出勤的天数来计算工资。通常，月工资除以月计薪天数（21.75天）得出日工资，再乘以实际出勤天数，即为应得工资。
- 对于计件工资的员工，则根据其实际完成的工作量和计件单价来计算工资。
包括各项应得收入：
- 工资计算应全面涵盖基本工资、绩效工资（如适用）、加班工资、奖金、津贴等各项应得收入。用人单位不得随意降低工资计算标准或克扣工资。
结算时间：
- 即使员工是自离，用人单位也应在完成工作交接或确定实际工作情况后，及时与员工结算工资。通常，这应在解除或终止劳动合同时一次性付清。
- 若此前约定的发薪日前决定离职，可能需依据劳动合同或公司规章制度执行，但不得违反法律关于一次性付清的规定。
二、特殊情况处理与扣除项目
未办理离职手续：
- 员工自离虽属擅自离岗，但用人单位仍应按法律规定结算工资。
- 用人单位可要求员工回来办理离职手续，完成工作交接。若员工拒绝，用人单位应书面通知相关后果并保留证据，但不得因此拒绝支付工资。
经济损失赔偿：
- 若员工自离给用人单位造成直接经济损失，如未完成工作导致的额外费用、损坏公司财物等，用人单位有权要求赔偿。
- 赔偿金额需有充分证据支持，且每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
其他扣除项目：
- 若员工有未归还的公司财物、借款等，用人单位可依据相关规定进行相应扣除，但需确保合法合规，并保留相关证据。
三、法律保障与注意事项
遵守法律法规：
- 用人单位在结算自离员工工资时，必须严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》、《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》等相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。
员工权益维护：
- 员工在离职前应尽可能了解公司的离职流程和工资结算规定，以便在离职时能够顺利办理相关手续并领取应得工资。
- 若员工认为工资结算存在不合理之处，可通过向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等合法途径维护自身权益。
总结来说，自离后的工资结算需遵循相关法律法规，确保用人单位与劳动者的双方权益得到合理保障。用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资，并考虑可能的扣除项目，但不得违反法律规定克扣工资。员工在离职前也应了解相关流程和规定，以便在离职时能够顺利领取应得工资。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。