关于您提出的“停车超过三分钟是否罚款”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况、地方政策以及交通管理部门的实际执行来综合判断。
一、一般原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例，机动车在道路上临时停车需严格遵守相关规定，如不得在禁停区域停车等。一旦违反这些规定，即构成违章停车，公安机关交通管理部门有权依法进行处罚。通常情况下，除非有特殊情况或地方特殊规定，否则违停即构成违章，处罚是不可撤销的。
二、可能撤销处罚的特殊情况
人性化执法及首次警告原则：
- 在一些地方，交通管理部门可能推行人性化执法，对于情节轻微、未影响交通且驾驶人在短时间内（如不超过三分钟）改正的违停行为，可能会按首次警告原则撤销处罚。但这并非全国统一规定，而是依据地方交通管理部门的处罚力度和实际情况决定。
证据不足：
- 如果记录违停的证据（如照片、视频）不能清晰反映违停全过程，包括时间、地点及对交通的影响，且无法确定违停时长，那么根据“疑罪从无”原则，处罚可能因证据不足而撤销。但这需要车主提供合理的说明和证据。
三、不可撤销处罚的情况
- 明确禁停区域或严重影响交通秩序：
- 在明确标识禁止停车的区域（如消防通道、医院急救通道、交叉路口等）违停，无论时间长短，均属严重违法，处罚通常不会撤销。
- 即使不在禁停区域，但如果违停导致交通拥堵或安全隐患，也不会因时间短而撤销处罚。
四、申诉权利与流程
- 如果您认为自己的违停处罚存在争议，特别是当停车时间未超过地方规定的缓冲时限（如有）或存在特殊情况时，您有权进行申诉。
- 申诉时，您需要准备车辆行驶证、驾驶证以及停车情况的证据（如行车记录仪视频、现场照片等）。
- 申诉方式可以选择线下前往当地交警大队办公地点提交申诉材料，或者线上通过交警部门的官方网站、手机APP等渠道进行。
总结：停车超过三分钟是否罚款，并没有一个固定的答案。它取决于多种因素，包括地方政策、交通管理部门的实际执行以及违停的具体情况。因此，作为车主，您应该严格遵守交通法规，规范停车行为，以避免不必要的处罚。如果面临违停处罚且认为存在争议，您可以根据具体情况咨询当地交通管理部门或寻求法律帮助，并依法行使自己的申诉权利。