关于高铁站停车超过三分钟是否会罚款的问题，这主要取决于具体的停车区域和管理规定。以下是对此问题的详细解答：

一、合规停车情况

在高铁站，通常会有专门设置且明确标识限停3分钟的区域，这是为了方便旅客快速上下车，提高交通效率。如果您的车辆停放在这些区域内，并且严格遵守了3分钟的时间限制，完成上下乘客等必要操作后及时驶离，那么是不会被罚款的。

二、违规停车及处罚

1. 超出规定时间停车：

   • 如果您在限停3分钟的区域内停车时间超过了3分钟，那么根据高铁站的管理规定和执法力度，您可能会面临罚款。罚款金额因地区而异，通常可能在100元到200元不等。部分地方还可能会根据违法停车行为进行扣分处理，如扣3分等。

2. 在禁止停车区域停车：

   • 即使您的停车时间未超过3分钟，但如果车辆停在了高铁站明确禁止停车的区域（这些区域通常有明显的标识牌提示），那么您也将被罚款。此类行为属于较为严重的交通违法行为，罚款金额一般较高，可能在200元左右，并可能伴随扣分处罚。

3. 执法人员现场处理：

   • 如果司机在现场，执法人员会首先指出其违法行为，并给予口头警告，责令其立即驶离。若司机拒绝立即驶离，则将依据相关法律法规处以罚款。
   • 如果司机不在现场，同样会依据法律法规处以罚款，实际执行中，罚款金额会根据具体情况裁定。

4. 其他处罚措施：

   • 除罚款外，执法部门还有权将违规停放的机动车拖移至不妨碍交通的地点或公安机关交通管理部门指定的地点停放，且拖车过程不得向当事人收取费用。

三、建议与应对措施

1. 提前了解规定：

   • 在前往高铁站停车前，建议您提前了解该站的停车管理规定，包括限停时间、禁停区域等，以便合理规划停车时间。

2. 严格遵守规定：

   • 在高铁站停车时，请务必严格遵守停车管理规定，不要超出限停时间或在禁停区域停车。

3. 及时沟通处理：

   • 如果您对停车超时处罚有异议，或者因特殊情况需要长时间停车，建议您及时与停车场管理方或执法人员沟通处理，以避免不必要的麻烦和损失。

综上所述，高铁站停车超过三分钟是否会罚款，取决于您停车的区域和管理规定。为了确保您的出行顺畅和避免不必要的罚款，请您务必提前了解并严格遵守高铁站的停车管理规定。