自收自支事业编在立案调查中，一般而言，并不影响其办理退休手续，但具体能否办理还需根据调查的性质、内容以及相关法律法规和政策规定来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、退休手续办理的基本条件
退休手续的办理通常基于员工的年龄、工龄、社保缴纳情况等基本条件。对于自收自支的事业编制员工而言，只要其满足法定的退休条件，如达到法定退休年龄、累计缴纳社保满一定年限等，原则上是可以办理退休手续的。
二、立案调查对退休手续办理的影响
调查性质与内容：
- 如果立案调查的内容与员工的退休资格无直接关联，如涉及的是员工在工作中的一般违规行为，而非严重违法违纪行为，那么这种调查通常不会影响员工的退休手续办理。
- 如果调查涉及员工是否存在严重违法违纪行为，且这些行为可能影响到其退休资格的认定（如贪污受贿、严重失职等），那么在调查结果未明确之前，相关部门可能会暂缓办理其退休手续。
相关法律法规与政策规定：
- 根据《中华人民共和国公务员法》及相关规定，公务员在违法违纪行为尚未查清前，不得晋升职务、职级、级别，其中受到降级、撤职、开除处分的，不得晋升工资档次。虽然这一规定主要针对公务员，但自收自支的事业编制员工在管理上可能参照类似规定执行。然而，这并不意味着在立案调查期间一定不能办理退休手续，而是需要根据具体情况来判断。
- 此外，各地可能还有关于事业单位员工退休管理的具体规定，这些规定可能对立案调查期间能否办理退休手续有更明确的要求。
三、实际操作中的建议
咨询相关部门：
- 在立案调查期间，如果自收自支的事业编制员工希望办理退休手续，建议首先咨询所在单位的人事部门或当地的人力资源和社会保障部门，了解具体的政策规定和操作流程。
等待调查结果：
- 如果调查涉及的问题较为严重，且可能影响到退休资格的认定，那么员工可能需要等待调查结果明确后再决定是否办理退休手续。
准备相关材料：
- 在办理退休手续时，员工需要准备相关的证明材料，如身份证、工作证、社保缴纳记录等。如果因立案调查而需要提供额外的证明材料或说明，员工应积极配合并提供。
四、可能的法律后果
- 如果员工在立案调查期间未经允许擅自办理退休手续，且后续调查发现其存在严重违法违纪行为，那么其退休资格可能会被撤销，并可能面临相应的法律责任。
- 如果员工在立案调查期间积极配合调查，且调查结果未发现其存在影响退休资格的严重问题，那么其退休手续的办理通常不会受到影响。
综上所述，自收自支事业编在立案调查中能否办理退休手续，需根据调查的性质、内容以及相关法律法规和政策规定来综合判断。建议员工在办理前咨询相关部门，了解具体政策规定和操作流程，以确保自己的权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。