在处理公司拖欠工资的情况时，选择保留劳动关系进行劳动仲裁还是解除劳动关系后进行劳动仲裁，各有利弊，需根据个人实际情况和需求来决定。以下是对两种选择的详细分析：
保留劳动关系进行劳动仲裁
优势：
- 维系劳动关系：选择在职仲裁，劳动者可以继续与用人单位保持劳动关系，避免因辞职带来的找工作的压力。
- 持续领工资：在仲裁期间，劳动者仍能正常出勤并获取工资，确保收入不受影响。
- 享受在职福利：劳动者可继续享受在职期间的各项福利和保障，如社保、公积金等。
- 仲裁程序简便高效：仲裁程序相对简便、高效，费用低。仲裁委自受理之日起45日内结案，案情复杂可延长15日。
劣势：
- 关系可能变差：在职状态可能会使劳动者与单位的关系变差，影响工作氛围。
- 面临单位压力：在职仲裁可能面临来自单位的压力，如排挤、打压等。
解除劳动关系后进行劳动仲裁
优势：
- 争取经济补偿：劳动者可依据《劳动合同法》以用人单位拖欠工资为由解除劳动合同，并要求支付经济补偿，标准为每满一年支付一个月工资。
- 无工作干扰：解除劳动关系后，劳动者无工作干扰，能全力投入仲裁。
- 明确诉求：解除劳动关系后，劳动者的诉求更加明确，即要求支付拖欠的工资和经济补偿。
劣势：
- 失业风险：解除劳动关系后，劳动者将失去现有工作，可能面临再就业难题。
- 社保缴纳衔接问题：被迫解除劳动合同后，劳动者的社保缴纳衔接可能会出现问题，影响自身权益。
- 起诉程序复杂：若对仲裁结果不服，劳动者可自收到仲裁裁决书之日起15日内向法院起诉。起诉程序相对复杂，耗时较长，需耗费更多精力和成本。
综合建议
- 若希望稳保工作：选择保留劳动关系进行劳动仲裁是较好的选择。这样可以在维持劳动关系的同时解决工资问题，避免因离职带来的不确定性，还可继续享有工作相关权益。
- 若希望尽快解决问题并获取经济补偿：且有新的就业机会或能够应对失业风险，选择解除劳动关系后进行劳动仲裁可能更合适。这样可以明确诉求，争取经济补偿，并全力投入仲裁。
无论选择哪种方式，都需要根据个人实际情况和需求来决定。如果您在面对拖欠工资情况时，对于仲裁后的执行难题、社保衔接等方面存在疑问，或者对保留劳动关系还是解除劳动关系进行劳动仲裁还有更多困惑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更详细的法律建议和指导。