针对您提出的“船员任职合同超期怎么办”的问题，这实际上涉及到了劳动合同的履行与解除问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，如果您的船员任职合同已经超期，那么您理论上已经完成了合同约定的服务期限。在这种情况下，您有权按照正常的休假程序向船舶主管提出休假申请，并由船舶主管转呈公司进行审批。这是您的合法权益，公司应当予以尊重并安排相应的休假。
然而，如果您的情况是合同尚未到期但您希望提前解除合同（这里我假设您可能想问的是合同未到期但想提前结束的情况，因为“超期”通常指已过合同期），那么您需要了解以下几种解除劳动合同的方式：
与用人单位协商一致解除： 您可以与公司船员主管或人力资源部门进行沟通，说明您提前解除合同的原因和意愿。如果公司同意，双方可以签订解除劳动合同的协议，明确解除的时间、方式以及可能涉及的补偿等问题。
劳动者单方面解除劳动合同： 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者有权提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。在试用期内，您只需提前三日通知即可。这是您的法定权利，公司应当接受。但需要注意的是，提前通知是为了给公司足够的时间来安排替代人员或调整工作计划，因此请务必遵守这一规定。
因用人单位违法情形解除劳动合同： 如果公司存在违法情形，如未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，您有权根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条单方面解除劳动合同，并且不需要提前通知公司。
特殊情况下的立即解除： 如果公司以暴力、威胁或非法限制人身自由的手段强迫您劳动，或者违章指挥、强令冒险作业危及您的人身安全，您有权立即解除劳动合同，并且不需要事先告知公司。
在处理这类问题时，我建议您首先与公司进行友好沟通，尽量通过协商的方式解决问题。如果沟通无果或公司存在违法行为，您可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。同时，也请您在解除合同前仔细考虑自己的职业规划和未来发展，确保做出明智的决策。