存量房买卖合同备案专用章在符合规定使用的情况下是有效的。以下从不同角度进行分析：

1. 从合同效力角度：

   • 存量房买卖合同备案专用章是用于证明该合同已经过相关部门备案登记的印章。备案登记本身并不直接决定合同的法律效力，但它是合同合法性和真实性的一个重要证明。
   • 只要合同内容合法、双方意思表示真实，且不存在其他导致合同无效的情形（如欺诈、胁迫、恶意串通等），那么即使合同上加盖的是备案专用章，该合同仍然是有效的。

2. 从印章使用角度：

   • 备案专用章的使用应当符合相关规定，即仅用于备案登记相关的文件上。如果错误地将备案专用章用于其他非备案文件上，可能会引发关于印章使用合规性的问题，但这并不直接导致合同无效。
   • 如果备案专用章被伪造或盗用，那么加盖该印章的合同可能面临效力争议。在这种情况下，需要依法追究伪造或盗用印章者的法律责任，并可能通过法律程序确认合同的效力。

3. 从实际操作角度：

   • 在实际操作中，存量房买卖合同备案专用章的使用通常与房屋交易管理部门的备案流程紧密相关。只要按照规定的流程进行备案，并正确使用备案专用章，那么该合同在法律上就是有效的。
   • 如果在备案过程中存在违规行为（如未按规定提交材料、虚假备案等），那么可能会影响合同的备案效力，但这同样不直接导致合同无效，而是可能面临行政处罚或合同履行障碍。

建议：

• 在签订存量房买卖合同时，务必确保合同内容合法、双方意思表示真实，并按照规定进行备案登记。
• 在使用备案专用章时，要确保其合规性，避免将备案专用章用于非备案文件上。
• 如果遇到关于存量房买卖合同或备案专用章的争议问题，建议及时咨询并向我提问，以便更好地维护自身权益。