不同地块合并办理工程规划许可证（工规证）是否合法，需结合具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：

1. 规划条件与地块性质

• 若地块规划条件允许合并：根据《城乡规划法》及相关地方规划管理规定，若不同地块在规划上属于同一功能分区（如同一住宅小区、商业综合体等），且合并后符合城市总体规划、控制性详细规划的要求（如建筑密度、容积率、绿地率等指标），则合并办理工规证是合法的。
• 若地块规划条件冲突：若地块性质不同（如住宅与工业用地混合），或合并后导致规划指标超标（如容积率突破上限），则合并办理可能违法，需调整规划或分开办理。

2. 土地权属与合同约定

• 权属一致：若不同地块属同一权利人所有，且土地出让合同、划拨决定书等文件未限制合并开发，则合并办理工规证无障碍。
• 权属分散：若地块分属不同权利人，需先通过协议转让、合作开发等方式整合权属，或取得所有权利人同意合并开发的书面文件，否则可能因权属纠纷导致工规证无效。

3. 审批程序与材料要求

• 合并申请材料：需提交合并后的总平面图、规划指标计算书、土地权属证明等材料，证明合并后符合规划要求。
• 审批流程：部分城市要求合并办理需先通过规划部门组织的专家论证或公示，确保无利害关系人反对。

4. 法律风险与合规建议

• 风险点：未经规划部门批准擅自合并地块开发，可能面临工规证被撤销、罚款甚至强制拆除的风险。
• 合规建议：
  1. 提前向当地规划部门咨询合并办理的可行性及具体要求；
  2. 委托专业机构进行规划合规性审查；
  3. 确保所有权属人同意合并，并留存书面证据。

5. 实践案例参考

• 合法案例：某开发商将相邻两宗住宅用地合并开发，因合并后容积率、绿地率等指标符合规划要求，且权属清晰，成功办理工规证。
• 违法案例：某企业将工业用地与住宅用地合并开发，因规划性质冲突被规划部门驳回申请，并责令恢复原状。

总结：不同地块合并办理工规证是否合法，需综合评估规划条件、土地权属、审批程序等因素。建议您在操作前委托专业律师或规划机构进行合规性审查，避免法律风险。如有具体地块信息或合同条款需要分析，可直接向我咨询。