针对您提出的“违章建筑达不成拆迁补偿协议怎么办”这一问题，首先需要明确的是，违章建筑本身在法律上是不受保护的，因为它违反了相关的建设规划和法律法规。然而，在处理违章建筑拆迁补偿问题时，仍需遵循一定的法律程序和原则，以保障相关方的合法权益。

若您作为违章建筑的所有人或使用人，与拆迁部门就补偿问题无法达成协议，您可以考虑以下途径来维护自己的权益（但需注意，违章建筑本身可能无法获得与合法建筑相同的补偿）：

1. 了解相关法律法规：

   • 首先，您需要了解当地关于违章建筑拆迁和补偿的相关法律法规，明确自己的权利和义务。

2. 与拆迁部门协商：

   • 尽管违章建筑可能无法获得全额补偿，但您仍可以与拆迁部门进行协商，争取获得一定的经济补偿或其他形式的安置。
   • 在协商过程中，您可以提出自己的合理诉求，并尝试与拆迁部门达成共识。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼：

   • 如果您认为拆迁部门的补偿决定不合理或存在违法行为，您可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 行政复议是由复议机关审查征收行为的合法性与合理性；行政诉讼则是由法院对拆迁补偿相关事宜作出公正判决。

4. 寻求法律专业人士的帮助：

   • 在处理此类法律问题时，寻求法律专业人士的帮助是非常重要的。他们可以为您提供专业的法律建议，并帮助您制定合适的维权策略。

5. 注意保留相关证据：

   • 在整个过程中，您需要注意保留与拆迁补偿相关的所有证据，如拆迁通知、补偿方案、协商记录等。这些证据在后续的维权过程中可能会起到关键作用。

然而，需要强调的是，由于违章建筑本身违反了法律法规，因此其补偿问题可能更加复杂和敏感。在处理此类问题时，您需要保持冷静和理性，遵循法律程序和原则来维护自己的权益。同时，也要认识到违章建筑可能无法获得与合法建筑相同的补偿待遇。

最后，建议您在处理此类问题时咨询当地法律专业人士或相关机构以获取更具体和准确的法律建议。