实习生跟公司的协议文件是否可以盖公司人事章，需结合具体情况分析：
从协议性质与盖章效力角度：
- 实习生与公司签订的协议，若属于劳动合同范畴（尽管实习生身份特殊，但某些情况下可能签订类似劳动合同的协议），则通常应加盖公司公章或合同专用章，以体现协议的正式性和法律效力。人事章主要用于人事管理相关事务，如员工入职、离职手续等，其效力范围可能不及于劳动合同等正式协议。
- 若协议仅为实习协议，明确双方实习期间的权利义务，且不涉及劳动合同的核心条款（如工资、社保、福利待遇等），则加盖人事章可能在一定程度上被接受，但具体还需看公司内部规定及协议内容。
从公司内部规定角度：
- 不同公司对于盖章的规定可能不同。有些公司可能明确规定，所有协议均需加盖公章或合同专用章；而有些公司则可能允许在特定情况下加盖人事章。因此，实习生在签订协议前，应了解并遵守公司的内部规定。
从法律风险角度：
- 若协议加盖的印章不符合公司规定或协议性质，可能导致协议在法律上被认定为无效或存在瑕疵。这将对实习生的权益保护产生不利影响，如无法依据协议主张权利、在发生纠纷时难以维权等。
法律建议：
- 实习生在签订与公司之间的协议时，应首先明确协议的性质和内容，确保协议符合法律法规的要求。
- 了解并遵守公司的内部规定，特别是关于盖章的规定。若公司规定协议需加盖公章或合同专用章，则应坚持此要求。
- 若对协议盖章问题存在疑问或担忧，可向公司的人力资源部门或法务部门咨询，以确保协议的合法性和有效性。
- 在签订协议前，务必仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保障。如有需要，可寻求专业律师的帮助进行协议审查。
总之，实习生跟公司的协议文件是否可以盖公司人事章，需结合协议性质、公司内部规定及法律风险等多方面因素进行综合考虑。在签订协议时，务必谨慎行事，确保自己的权益得到充分保障。如有任何法律问题或疑虑，可直接向我咨询。