关于实习生协议盖人事章是否有效的问题，这主要取决于实习协议的具体内容以及实习生与实习单位之间的实际关系。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确实习生与实习单位之间的法律关系。在校学生以社会实践或者勤工俭学为目的的实习，通常被认定为劳务关系，而非劳动关系。这是因为在校学生并非以提供劳动获得的工资报酬作为主要生活来源，且其学籍管理和档案管理关系均在学校。因此，实习生与实习单位之间的权利义务关系主要受《民法典》等民事法律的调整。

接下来，我们分析实习协议的有效性。实习协议作为实习生与实习单位之间约定权利义务的书面文件，其有效性并不完全取决于盖章的部门。无论是人事章还是公司公章，只要该章是实习单位合法有效的印章，且实习协议的内容合法、双方意思表示真实，那么该协议就是有效的。关键在于协议的内容是否明确、具体，是否涵盖了双方的权利义务、实习期限、实习报酬等关键条款。

然而，需要注意的是，如果实习生与实习单位之间实际上构成了劳动关系（例如，应届毕业生以就业为目的的实习，且双方已达成建立劳动关系的合意），那么实习协议可能无法完全替代书面劳动合同。在这种情况下，实习单位应按照《劳动合同法》的规定，与实习生签订书面劳动合同，并明确约定劳动合同期限、工作内容、劳动报酬、社会保险等必备条款。

此外，我还想提醒您的是，无论实习协议是否盖有人事章或公司公章，实习生在签订协议前都应仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。如果实习单位拒绝签订实习协议或协议内容存在模糊、不明确的情况，实习生有权要求实习单位进行修改或补充，甚至可以选择拒绝实习或寻求法律援助。

综上所述，实习生协议盖人事章本身并不影响协议的有效性，关键在于协议的内容是否合法、双方意思表示是否真实，以及实习生与实习单位之间的实际关系是否构成劳动关系。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。