商户起火起诉楼上全部住户赔偿是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 火灾原因与责任认定：

   • 如果火灾是由于楼上某住户的过失行为（如违规使用电器、乱扔烟蒂等）直接导致的，那么该住户应当承担相应的赔偿责任。此时，商户起诉该住户是合法的。
   • 如果火灾原因无法确定，或者并非由楼上住户的过失行为导致，而是由于商户自身管理不善、设备故障等原因造成的，那么商户起诉楼上全部住户赔偿则可能缺乏法律依据。

2. 共同危险行为与连带责任：

   • 在某些情况下，如果楼上住户的行为共同构成了对商户的潜在危险，且无法确定具体是哪一住户的行为导致了火灾，那么根据《民法典》中关于共同危险行为的规定，所有参与共同危险行为的住户可能需要承担连带责任。但这种情况较为特殊，需要具体证据支持。

3. 公平责任原则：

   • 如果火灾确实给商户造成了损失，且无法确定具体责任人，但楼上住户的行为与火灾之间存在一定的关联性（如住户未遵守消防安全规定，增加了火灾风险），那么根据公平责任原则，法院可能会酌情判决楼上住户承担一定的补偿责任。但这并非严格的赔偿责任，而是基于公平原则的补偿。

4. 诉讼策略与证据收集：

   • 商户在起诉前，应当充分收集证据，证明火灾与楼上住户的行为之间存在因果关系。这包括但不限于消防部门的火灾调查报告、监控录像、证人证言等。
   • 同时，商户也需要考虑诉讼策略，避免盲目起诉所有楼上住户，导致诉讼成本过高且难以获得有效赔偿。

法律建议：

• 对于商户而言，如果确实认为火灾与楼上住户的行为有关，应当及时咨询专业律师，了解诉讼风险和可能的赔偿范围。
• 在起诉前，务必充分收集证据，确保诉讼有据可依。
• 对于楼上住户而言，如果收到起诉状，应当积极应对，了解自己的权利和义务，必要时也可以咨询专业律师进行辩护。

总之，商户起火起诉楼上全部住户赔偿是否合法，需根据火灾原因、责任认定以及相关法律规定进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。