针对员工不服从管理并提交被迫离职申请的情况，公司可以采取以下措施来处理：

1. 核实员工离职原因：

   • 首先，公司需要核实员工提交的被迫离职申请是否真实有效，以及员工所称的“被迫”是否确实存在。这可能涉及到与员工进行沟通，了解其离职的具体原因和背景。
   • 如果员工提出的离职原因与事实不符，或者公司认为员工的行为并不构成被迫离职，公司可以拒绝接受员工的离职申请，并要求员工继续履行劳动合同。

2. 审查公司规章制度：

   • 公司应审查自身的规章制度，确保其中对于员工不服从管理、违反工作纪律等行为有明确的处罚规定。
   • 如果员工的违规行为符合规章制度中的处罚条款，公司可以依据规章制度对员工进行相应的处罚，如警告、罚款、降职等。

3. 考虑解除劳动合同：

   • 如果员工的不服从管理行为严重违反了公司的规章制度，或者给公司造成了重大损失，公司可以考虑依据《劳动合同法》的相关规定，解除与该员工的劳动合同。
   • 在解除劳动合同前，公司应确保已经履行了必要的程序，如与员工进行沟通、听取其申辩意见等，并确保解除劳动合同的决定符合法律规定。

4. 防范法律风险：

   • 在处理员工不服从管理并提交被迫离职申请的情况时，公司应特别注意防范法律风险。例如，避免在处理过程中侵犯员工的合法权益，如随意克扣工资、非法解雇等。
   • 如果公司对处理方式存在疑虑，或者担心可能引发法律纠纷，建议及时咨询专业律师的意见，以确保公司的处理方式合法合规。

5. 完善管理制度：

   • 此次事件也提醒公司应进一步完善管理制度，明确员工的行为规范和公司的处罚措施。
   • 通过加强员工培训、提高管理水平等方式，减少类似事件的发生，维护公司的正常运营秩序。

综上所述，公司在处理员工不服从管理并提交被迫离职申请的情况时，应核实离职原因、审查规章制度、考虑解除劳动合同（如适用）、防范法律风险，并完善管理制度。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。