晚上交通执法大队单独查非法营运是合法的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 执法权限与职责：

   • 交通执法大队作为负责交通运输领域行政执法的机构，具有查处非法营运等违法行为的法定职责。这一职责并不受时间（如白天或晚上）的限制。
   • 非法营运行为严重扰乱了正常的客运市场秩序，并可能带来安全隐患，因此交通执法大队有权在任何时间进行查处，以维护市场秩序和公共安全。

2. 执法方式的合法性：

   • 交通执法大队在查处非法营运时，通常会采取多种方式，包括但不限于现场检查、询问乘客、查看车辆证件等。这些执法方式在法律上都是被允许的，且不受时间限制。
   • 单独执法并不意味着执法行为的非法性。只要执法人员按照法定程序进行，且具备相应的执法资格和权限，其执法行为就是合法的。

3. 实际案例与法律依据：

   • 从实际案例来看，交通执法大队经常在晚上开展夜查行动，严厉打击非法营运行为。这些行动都得到了法律的支持和认可。
   • 《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规明确规定了非法营运的定义和处罚措施，为交通执法大队的查处行为提供了法律依据。

4. 对公众的影响与保障：

   • 交通执法大队晚上查处非法营运，实际上是在为公众提供更加安全、有序的出行环境。非法营运车辆往往存在安全隐患，且可能扰乱市场秩序，影响其他合法经营者的利益。
   • 通过查处非法营运，交通执法大队能够维护客运市场的正常秩序，保障公众的出行安全。

综上所述，晚上交通执法大队单独查非法营运是合法的。这一行为不仅符合法律法规的规定，也是维护客运市场秩序和公共安全的必要举措。如果您在交通运输领域遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询。